More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2106 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  100 
 
 
371 aa  761    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1787  AAA ATPase family protein  64.4 
 
 
372 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0698  ATPase central domain-containing protein  55.03 
 
 
385 aa  408  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.24522  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  51.8 
 
 
371 aa  340  2e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  51.2 
 
 
371 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  50.72 
 
 
371 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  49.85 
 
 
372 aa  334  1e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  49.85 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  39.08 
 
 
407 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.45 
 
 
735 aa  169  9e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  39.08 
 
 
407 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.83 
 
 
584 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.4 
 
 
769 aa  166  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  38.31 
 
 
407 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.83 
 
 
732 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.67 
 
 
642 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.08 
 
 
638 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.3 
 
 
768 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.68 
 
 
644 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.26 
 
 
642 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.26 
 
 
642 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.08 
 
 
638 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.26 
 
 
640 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.08 
 
 
638 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0091  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.82 
 
 
625 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00172576  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  34.26 
 
 
584 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.67 
 
 
640 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.5 
 
 
685 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.67 
 
 
640 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.87 
 
 
801 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.85 
 
 
731 aa  162  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  38.91 
 
 
647 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  38.91 
 
 
650 aa  162  9e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.33 
 
 
638 aa  162  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.41 
 
 
640 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  39.75 
 
 
638 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  39.75 
 
 
640 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.43 
 
 
645 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.74 
 
 
659 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.09 
 
 
736 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.55 
 
 
644 aa  161  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.64 
 
 
731 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  37.96 
 
 
584 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  36.71 
 
 
577 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  37.9 
 
 
584 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.43 
 
 
626 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.33 
 
 
621 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.26 
 
 
643 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  39 
 
 
665 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.75 
 
 
638 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  38.91 
 
 
637 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.26 
 
 
648 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  37.15 
 
 
630 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.66 
 
 
804 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.65 
 
 
671 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  38.74 
 
 
691 aa  160  5e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00158  cell division protease FtsH  38.87 
 
 
646 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  38.33 
 
 
628 aa  160  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.73 
 
 
718 aa  159  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  39.33 
 
 
638 aa  159  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  38.62 
 
 
649 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  33.86 
 
 
722 aa  159  7e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.62 
 
 
651 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.45 
 
 
731 aa  159  7e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  38.43 
 
 
644 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.24 
 
 
656 aa  159  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000729584  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.87 
 
 
645 aa  159  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.11 
 
 
639 aa  159  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  38.43 
 
 
645 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  38.43 
 
 
649 aa  159  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.93 
 
 
740 aa  159  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  40.93 
 
 
713 aa  159  8e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.31 
 
 
651 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.29 
 
 
737 aa  159  9e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.55 
 
 
646 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  38.87 
 
 
645 aa  159  9e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  38.02 
 
 
764 aa  159  9e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  38.21 
 
 
647 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  38.21 
 
 
647 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  38.21 
 
 
647 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.55 
 
 
646 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.62 
 
 
654 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.74 
 
 
651 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  39.74 
 
 
627 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  38.21 
 
 
647 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  38.84 
 
 
681 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  37.4 
 
 
681 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.43 
 
 
617 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.94 
 
 
793 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.33 
 
 
635 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  38.06 
 
 
644 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.06 
 
 
647 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  38.06 
 
 
647 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  39.33 
 
 
635 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.24 
 
 
636 aa  158  2e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  38.21 
 
 
647 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  38.58 
 
 
407 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.33 
 
 
635 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  38.06 
 
 
644 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  38.06 
 
 
647 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>