More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0559 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 801 aa  1619    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.11 
 
 		 669 aa  680    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.52 
 
 		 684 aa  697    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.99 
 
 		 793 aa  1008    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.94 
 
 		 798 aa  923    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.95 
 
 		 682 aa  685    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  63.88 
 
 		 760 aa  941    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  61.5 
 
 		 682 aa  735    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.59 
 
 		 677 aa  674    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.21 
 
 		 671 aa  766    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  67.16 
 
 		 784 aa  921    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.1 
 
 		 685 aa  719    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.06 
 
 		 760 aa  912    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  58.53 
 
 		 753 aa  689    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.38 
 
 		 794 aa  932    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  60.16 
 
 		 656 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.07 
 
 		 662 aa  792    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  67.02 
 
 		 783 aa  920    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.17 
 
 		 696 aa  682    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.77 
 
 		 659 aa  666    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.78 
 
 		 672 aa  729    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.92 
 
 		 679 aa  731    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67 
 
 		 753 aa  693    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.76 
 
 		 687 aa  697    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.62 
 
 		 669 aa  770    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  58.01 
 
 		 689 aa  684    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.74 
 
 		 671 aa  745    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.93 
 
 		 672 aa  714    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.3 
 
 		 743 aa  896    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  61.44 
 
 		 654 aa  750    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  59.52 
 
 		 681 aa  680    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  67.02 
 
 		 783 aa  920    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.75 
 
 		 781 aa  953    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.23 
 
 		 684 aa  681    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.21 
 
 		 698 aa  655    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  53.73 
 
 		 627 aa  621  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.61 
 
 		 653 aa  618  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  50 
 
 		 704 aa  614  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.39 
 
 		 615 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.88 
 
 		 639 aa  608  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.46 
 
 		 651 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.32 
 
 		 643 aa  601  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.04 
 
 		 602 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  51.97 
 
 		 769 aa  597  1e-169  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 		 608 aa  593  1e-168  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  54.72 
 
 		 614 aa  594  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.23 
 
 		 657 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  57.2 
 
 		 697 aa  591  1e-167  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 		 599 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.34 
 
 		 621 aa  589  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 		 604 aa  586  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.4 
 
 		 611 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.68 
 
 		 759 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.58 
 
 		 639 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.18 
 
 		 648 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.91 
 
 		 620 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  57.66 
 
 		 608 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  58.04 
 
 		 499 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 		 601 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.61 
 
 		 608 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.85 
 
 		 750 aa  573  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.13 
 
 		 697 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.13 
 
 		 697 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.39 
 
 		 635 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.98 
 
 		 643 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.47 
 
 		 640 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  54.81 
 
 		 693 aa  573  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.98 
 
 		 638 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 601 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.81 
 
 		 632 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  59.05 
 
 		 681 aa  574  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  55.82 
 
 		 700 aa  571  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  52.61 
 
 		 640 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 		 635 aa  572  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.26 
 
 		 630 aa  567  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.14 
 
 		 783 aa  567  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.68 
 
 		 612 aa  566  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.68 
 
 		 612 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.51 
 
 		 638 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.11 
 
 		 638 aa  566  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.04 
 
 		 645 aa  567  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.65 
 
 		 619 aa  568  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 		 626 aa  566  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.59 
 
 		 652 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  58.6 
 
 		 633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  58.6 
 
 		 633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  58.6 
 
 		 633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  58.81 
 
 		 633 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  58.05 
 
 		 633 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.26 
 
 		 633 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.62 
 
 		 676 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  58.6 
 
 		 633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.42 
 
 		 640 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  58.13 
 
 		 645 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.94 
 
 		 638 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  58.6 
 
 		 633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.81 
 
 		 617 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  51.79 
 
 		 764 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  55.04 
 
 		 652 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.6 
 
 		 647 aa  565  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>