More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4856 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  84.64 
 
 		 794 aa  1225    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.31 
 
 		 793 aa  957    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.4 
 
 		 682 aa  663    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.68 
 
 		 696 aa  679    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.83 
 
 		 687 aa  672    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.24 
 
 		 684 aa  688    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  60.47 
 
 		 682 aa  727    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.78 
 
 		 669 aa  756    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.16 
 
 		 659 aa  676    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.65 
 
 		 679 aa  719    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.07 
 
 		 672 aa  716    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.28 
 
 		 669 aa  671    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.84 
 
 		 671 aa  746    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  60.2 
 
 		 656 aa  714    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.88 
 
 		 662 aa  768    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.04 
 
 		 698 aa  652    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  61.4 
 
 		 753 aa  708    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.16 
 
 		 801 aa  902    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.27 
 
 		 753 aa  709    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.35 
 
 		 760 aa  914    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.86 
 
 		 685 aa  708    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  99.23 
 
 		 784 aa  1422    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  100 
 
 		 783 aa  1593    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.59 
 
 		 677 aa  669    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.56 
 
 		 684 aa  678    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.53 
 
 		 743 aa  900    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.98 
 
 		 672 aa  724    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  84.11 
 
 		 760 aa  1207    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  57.59 
 
 		 689 aa  668    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  59.75 
 
 		 654 aa  733    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  64.01 
 
 		 798 aa  955    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  56.6 
 
 		 681 aa  667    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  100 
 
 		 783 aa  1593    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  86.57 
 
 		 781 aa  1283    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.18 
 
 		 671 aa  746    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.56 
 
 		 704 aa  625  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.13 
 
 		 643 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.04 
 
 		 653 aa  610  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  63.2 
 
 		 627 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.63 
 
 		 639 aa  598  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.92 
 
 		 651 aa  596  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.16 
 
 		 615 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  52.36 
 
 		 697 aa  594  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.06 
 
 		 759 aa  588  1e-166  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 		 602 aa  585  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 		 608 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 604 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  50.97 
 
 		 769 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.32 
 
 		 611 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.92 
 
 		 750 aa  576  1.0000000000000001e-163  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  52.09 
 
 		 681 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.64 
 
 		 620 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  54.8 
 
 		 614 aa  569  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.57 
 
 		 632 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.65 
 
 		 783 aa  570  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  57.26 
 
 		 499 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.34 
 
 		 648 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.31 
 
 		 635 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 		 643 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.56 
 
 		 640 aa  567  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.85 
 
 		 640 aa  565  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.97 
 
 		 638 aa  565  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.59 
 
 		 645 aa  568  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  50.9 
 
 		 643 aa  568  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  50.25 
 
 		 644 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 		 647 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  48.43 
 
 		 700 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.76 
 
 		 638 aa  564  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.98 
 
 		 638 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.69 
 
 		 657 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.84 
 
 		 640 aa  565  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  50.25 
 
 		 647 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  50.41 
 
 		 647 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  47.62 
 
 		 764 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  50.25 
 
 		 644 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.61 
 
 		 643 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  50.41 
 
 		 647 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  50.41 
 
 		 647 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  50.25 
 
 		 644 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  50.16 
 
 		 649 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  50.25 
 
 		 647 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  50.58 
 
 		 637 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  50.25 
 
 		 647 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  50.25 
 
 		 647 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  50.41 
 
 		 647 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.03 
 
 		 608 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.49 
 
 		 659 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.62 
 
 		 647 aa  562  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  50.25 
 
 		 644 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 		 639 aa  559  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  49.92 
 
 		 644 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  53.93 
 
 		 608 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 		 650 aa  561  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.43 
 
 		 638 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 		 651 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  49.34 
 
 		 612 aa  560  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  50.08 
 
 		 647 aa  561  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 		 676 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  49.92 
 
 		 647 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.33 
 
 		 697 aa  557  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>