More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13642 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.91 
 
 		 671 aa  746    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  85.84 
 
 		 794 aa  1173    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.85 
 
 		 684 aa  692    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.28 
 
 		 793 aa  951    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.19 
 
 		 743 aa  928    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  60.15 
 
 		 682 aa  732    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.29 
 
 		 672 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.44 
 
 		 669 aa  761    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  61.93 
 
 		 656 aa  727    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.55 
 
 		 687 aa  677    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.25 
 
 		 669 aa  670    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  100 
 
 		 760 aa  1545    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  85.65 
 
 		 784 aa  1189    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.82 
 
 		 672 aa  727    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  61.98 
 
 		 753 aa  711    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.6 
 
 		 753 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.06 
 
 		 696 aa  673    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  85.79 
 
 		 783 aa  1189    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  63.78 
 
 		 798 aa  960    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.04 
 
 		 662 aa  782    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.06 
 
 		 671 aa  745    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.44 
 
 		 684 aa  682    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.3 
 
 		 679 aa  736    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.23 
 
 		 659 aa  685    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.86 
 
 		 677 aa  657    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  58.27 
 
 		 689 aa  670    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.7 
 
 		 801 aa  912    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.82 
 
 		 698 aa  649    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  61.5 
 
 		 654 aa  749    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.01 
 
 		 760 aa  916    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  56.67 
 
 		 681 aa  662    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.16 
 
 		 685 aa  704    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  85.79 
 
 		 783 aa  1189    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.77 
 
 		 682 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  81.44 
 
 		 781 aa  1228    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.4 
 
 		 653 aa  624  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.28 
 
 		 704 aa  623  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.82 
 
 		 643 aa  620  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  63.4 
 
 		 627 aa  622  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.11 
 
 		 651 aa  612  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.15 
 
 		 639 aa  606  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  52.99 
 
 		 697 aa  601  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.71 
 
 		 759 aa  602  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.37 
 
 		 602 aa  598  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.45 
 
 		 615 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.99 
 
 		 608 aa  587  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  52.34 
 
 		 769 aa  585  1e-166  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.54 
 
 		 611 aa  578  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.75 
 
 		 750 aa  582  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  58.16 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  58.45 
 
 		 614 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.64 
 
 		 604 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 638 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.57 
 
 		 657 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.79 
 
 		 632 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.15 
 
 		 635 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.75 
 
 		 640 aa  575  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  48.51 
 
 		 700 aa  571  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.31 
 
 		 783 aa  570  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.52 
 
 		 610 aa  570  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  54.56 
 
 		 613 aa  570  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.82 
 
 		 620 aa  569  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.2 
 
 		 610 aa  567  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  57.52 
 
 		 608 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.55 
 
 		 662 aa  565  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.23 
 
 		 643 aa  566  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.96 
 
 		 626 aa  567  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.36 
 
 		 640 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.64 
 
 		 697 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  57.7 
 
 		 681 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.64 
 
 		 697 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  49.34 
 
 		 643 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.41 
 
 		 638 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.11 
 
 		 640 aa  565  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.39 
 
 		 639 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  49.18 
 
 		 647 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  49.18 
 
 		 647 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.97 
 
 		 616 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  49.18 
 
 		 647 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 		 659 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.01 
 
 		 608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  49.18 
 
 		 647 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  49.09 
 
 		 644 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  47.83 
 
 		 617 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.24 
 
 		 616 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.22 
 
 		 638 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  57.43 
 
 		 640 aa  559  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  55.45 
 
 		 613 aa  562  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.53 
 
 		 652 aa  560  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.79 
 
 		 643 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  47.9 
 
 		 617 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.21 
 
 		 607 aa  558  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.71 
 
 		 630 aa  560  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.78 
 
 		 638 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.16 
 
 		 638 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  49.09 
 
 		 644 aa  560  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  49.09 
 
 		 647 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.51 
 
 		 651 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 		 647 aa  561  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  49.09 
 
 		 647 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>