More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1848 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.56 
 
 
671 aa  662    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.38 
 
 
684 aa  761    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.73 
 
 
704 aa  701    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.86 
 
 
684 aa  747    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  56.41 
 
 
682 aa  697    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.5 
 
 
659 aa  761    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.54 
 
 
669 aa  761    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.48 
 
 
672 aa  663    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.34 
 
 
682 aa  751    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  56.31 
 
 
753 aa  664    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.27 
 
 
671 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.4 
 
 
698 aa  716    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.62 
 
 
677 aa  756    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.65 
 
 
687 aa  738    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.15 
 
 
685 aa  647    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.22 
 
 
679 aa  667    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.56 
 
 
760 aa  639    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  100 
 
 
697 aa  1426    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.27 
 
 
669 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.4 
 
 
753 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.86 
 
 
696 aa  704    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  58.53 
 
 
689 aa  744    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  74.82 
 
 
769 aa  1000    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  55.09 
 
 
656 aa  672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  54.55 
 
 
654 aa  678    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  55.33 
 
 
681 aa  677    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.8 
 
 
662 aa  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.18 
 
 
672 aa  712    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.47 
 
 
798 aa  634  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.69 
 
 
793 aa  624  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.38 
 
 
743 aa  625  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.34 
 
 
794 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  52.04 
 
 
760 aa  608  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.6 
 
 
781 aa  611  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  50.86 
 
 
784 aa  601  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  51.02 
 
 
783 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  51.02 
 
 
783 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.13 
 
 
801 aa  585  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.12 
 
 
615 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.4 
 
 
602 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.26 
 
 
653 aa  562  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.42 
 
 
639 aa  559  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.46 
 
 
643 aa  560  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  48.77 
 
 
627 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  47.69 
 
 
614 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.53 
 
 
611 aa  551  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.18 
 
 
652 aa  549  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.21 
 
 
759 aa  546  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  48.13 
 
 
608 aa  545  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.38 
 
 
651 aa  545  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.43 
 
 
617 aa  545  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.42 
 
 
620 aa  542  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.58 
 
 
608 aa  540  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.69 
 
 
604 aa  540  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.88 
 
 
657 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.84 
 
 
612 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  54.49 
 
 
499 aa  538  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.45 
 
 
612 aa  537  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.9 
 
 
750 aa  538  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0018  FtsH-2 peptidase  52.85 
 
 
695 aa  538  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.01 
 
 
662 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.94 
 
 
783 aa  532  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.3 
 
 
630 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.41 
 
 
635 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.11 
 
 
617 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.77 
 
 
621 aa  535  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.54 
 
 
639 aa  535  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.98 
 
 
632 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  52.54 
 
 
631 aa  529  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  45.83 
 
 
662 aa  529  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.01 
 
 
652 aa  531  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.86 
 
 
645 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  51.81 
 
 
652 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.81 
 
 
643 aa  528  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.64 
 
 
676 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.83 
 
 
640 aa  525  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  46.17 
 
 
681 aa  528  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.3 
 
 
697 aa  528  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.07 
 
 
640 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.56 
 
 
640 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.3 
 
 
697 aa  528  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.67 
 
 
638 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  46.97 
 
 
700 aa  524  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.45 
 
 
634 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  54.91 
 
 
633 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  54.91 
 
 
633 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.29 
 
 
660 aa  523  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.48 
 
 
614 aa  523  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.87 
 
 
640 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.47 
 
 
608 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  54.91 
 
 
633 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.65 
 
 
652 aa  523  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.02 
 
 
607 aa  523  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  54.91 
 
 
633 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.08 
 
 
610 aa  525  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.03 
 
 
601 aa  522  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.03 
 
 
601 aa  522  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  54.91 
 
 
633 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.58 
 
 
673 aa  523  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.7 
 
 
650 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>