More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5372 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.21 
 
 
704 aa  637    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  89.33 
 
 
784 aa  1243    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.14 
 
 
672 aa  732    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  64.26 
 
 
798 aa  956    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.29 
 
 
672 aa  721    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.28 
 
 
696 aa  679    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  61.09 
 
 
682 aa  729    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.6 
 
 
682 aa  677    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.34 
 
 
669 aa  758    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  89.96 
 
 
794 aa  1283    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.51 
 
 
698 aa  656    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.83 
 
 
671 aa  742    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.89 
 
 
801 aa  914    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.55 
 
 
793 aa  962    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.78 
 
 
753 aa  713    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  62.15 
 
 
753 aa  713    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  83.75 
 
 
760 aa  1217    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  60.69 
 
 
656 aa  721    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.58 
 
 
684 aa  685    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.13 
 
 
684 aa  686    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  89.33 
 
 
783 aa  1241    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.71 
 
 
743 aa  923    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.39 
 
 
687 aa  679    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.39 
 
 
662 aa  765    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.36 
 
 
677 aa  673    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.31 
 
 
671 aa  743    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  57.75 
 
 
689 aa  668    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.88 
 
 
760 aa  919    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.88 
 
 
669 aa  674    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  61.91 
 
 
654 aa  734    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.95 
 
 
679 aa  733    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.16 
 
 
685 aa  713    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  56.42 
 
 
681 aa  666    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  89.33 
 
 
783 aa  1241    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
781 aa  1587    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.42 
 
 
659 aa  682    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.1 
 
 
643 aa  622  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.1 
 
 
653 aa  616  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  64.07 
 
 
627 aa  613  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.22 
 
 
639 aa  610  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.81 
 
 
651 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.47 
 
 
759 aa  599  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  53.33 
 
 
697 aa  600  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.69 
 
 
615 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.75 
 
 
608 aa  593  1e-168  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.1 
 
 
604 aa  592  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  58.49 
 
 
499 aa  588  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.6 
 
 
602 aa  588  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  51.13 
 
 
769 aa  579  1e-164  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.45 
 
 
648 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  58.54 
 
 
614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.62 
 
 
611 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  57.83 
 
 
681 aa  578  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.37 
 
 
643 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.88 
 
 
750 aa  578  1.0000000000000001e-163  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.17 
 
 
645 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.66 
 
 
620 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.93 
 
 
643 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.42 
 
 
640 aa  575  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.04 
 
 
640 aa  574  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.31 
 
 
638 aa  571  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.01 
 
 
783 aa  572  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.94 
 
 
632 aa  572  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.65 
 
 
640 aa  570  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.24 
 
 
638 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  51.24 
 
 
637 aa  569  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.67 
 
 
642 aa  569  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.84 
 
 
626 aa  570  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.12 
 
 
645 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.21 
 
 
657 aa  568  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.86 
 
 
640 aa  567  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.3 
 
 
635 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 
639 aa  568  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  54.98 
 
 
640 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.74 
 
 
659 aa  568  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.05 
 
 
638 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  53.22 
 
 
613 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  50.41 
 
 
643 aa  566  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.7 
 
 
638 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  51.26 
 
 
764 aa  568  1e-160  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.73 
 
 
647 aa  567  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  54.98 
 
 
700 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  55.74 
 
 
644 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.31 
 
 
697 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.83 
 
 
676 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.86 
 
 
610 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  57.49 
 
 
608 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.67 
 
 
642 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.67 
 
 
642 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.33 
 
 
638 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.24 
 
 
651 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.09 
 
 
640 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.2 
 
 
662 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.29 
 
 
608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  55.49 
 
 
649 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.31 
 
 
697 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.13 
 
 
652 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.54 
 
 
610 aa  560  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.93 
 
 
638 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  49.84 
 
 
647 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>