More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1132 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 		 659 aa  729    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.94 
 
 		 704 aa  702    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.43 
 
 		 698 aa  697    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  52.95 
 
 		 682 aa  669    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.63 
 
 		 672 aa  643    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.06 
 
 		 669 aa  662    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.87 
 
 		 679 aa  653    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  100 
 
 		 769 aa  1585    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.77 
 
 		 671 aa  661    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  54.76 
 
 		 753 aa  637    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.06 
 
 		 671 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.45 
 
 		 677 aa  747    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  51.62 
 
 		 656 aa  643    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 		 669 aa  733    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.52 
 
 		 684 aa  743    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.36 
 
 		 684 aa  745    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.81 
 
 		 696 aa  704    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  76.45 
 
 		 697 aa  997    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.16 
 
 		 682 aa  735    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.98 
 
 		 662 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  56.72 
 
 		 689 aa  726    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.96 
 
 		 687 aa  724    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  51.72 
 
 		 654 aa  658    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  52.11 
 
 		 681 aa  663    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.37 
 
 		 672 aa  666    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.69 
 
 		 685 aa  634  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.05 
 
 		 753 aa  632  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.84 
 
 		 798 aa  624  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51 
 
 		 760 aa  624  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.46 
 
 		 743 aa  617  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  59.76 
 
 		 760 aa  597  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.31 
 
 		 793 aa  597  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.27 
 
 		 781 aa  589  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  58.35 
 
 		 784 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.35 
 
 		 794 aa  587  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  58.75 
 
 		 783 aa  588  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.39 
 
 		 801 aa  586  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  58.75 
 
 		 783 aa  588  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.13 
 
 		 643 aa  568  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.56 
 
 		 615 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.04 
 
 		 602 aa  548  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.44 
 
 		 653 aa  547  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  55.19 
 
 		 614 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.15 
 
 		 639 aa  536  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.85 
 
 		 611 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  47.73 
 
 		 608 aa  537  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.71 
 
 		 612 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.35 
 
 		 652 aa  538  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.32 
 
 		 759 aa  537  1e-151  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.83 
 
 		 657 aa  535  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  51.7 
 
 		 627 aa  535  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.81 
 
 		 783 aa  535  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.11 
 
 		 612 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 651 aa  532  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.47 
 
 		 617 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.68 
 
 		 607 aa  527  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.62 
 
 		 617 aa  527  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.03 
 
 		 604 aa  527  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.79 
 
 		 652 aa  526  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.95 
 
 		 608 aa  524  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.83 
 
 		 750 aa  523  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0018  FtsH-2 peptidase  52.14 
 
 		 695 aa  525  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.2 
 
 		 662 aa  520  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  52.75 
 
 		 499 aa  521  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.96 
 
 		 640 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.39 
 
 		 610 aa  521  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.72 
 
 		 632 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  52.15 
 
 		 652 aa  521  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.51 
 
 		 635 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  44.98 
 
 		 617 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  44.34 
 
 		 617 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  53.24 
 
 		 602 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.99 
 
 		 645 aa  516  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  45.14 
 
 		 617 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.78 
 
 		 638 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.93 
 
 		 614 aa  514  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.91 
 
 		 610 aa  514  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.48 
 
 		 676 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  56.33 
 
 		 613 aa  515  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.46 
 
 		 697 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.61 
 
 		 660 aa  514  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.68 
 
 		 639 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.02 
 
 		 640 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.63 
 
 		 647 aa  514  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  48.23 
 
 		 693 aa  515  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.83 
 
 		 599 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.11 
 
 		 640 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.39 
 
 		 608 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.46 
 
 		 697 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.63 
 
 		 696 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.6 
 
 		 621 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.44 
 
 		 633 aa  510  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  53.24 
 
 		 633 aa  509  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  53.24 
 
 		 633 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.8 
 
 		 639 aa  509  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.7 
 
 		 631 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.4 
 
 		 640 aa  511  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.4 
 
 		 655 aa  512  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  53.24 
 
 		 633 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.49 
 
 		 616 aa  512  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>