More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1787 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1787  AAA ATPase family protein  100 
 
 
372 aa  760    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  64.4 
 
 
371 aa  496  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0698  ATPase central domain-containing protein  55.71 
 
 
385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.24522  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  47.25 
 
 
372 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  47.54 
 
 
371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  46.38 
 
 
371 aa  322  8e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  46.09 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  48.7 
 
 
371 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.88 
 
 
804 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.74 
 
 
735 aa  155  8e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  36.75 
 
 
410 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  38.69 
 
 
764 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.17 
 
 
718 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.42 
 
 
756 aa  149  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.45 
 
 
731 aa  149  7e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.46 
 
 
769 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.61 
 
 
805 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
731 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.79 
 
 
731 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.03 
 
 
731 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.84 
 
 
732 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.31 
 
 
759 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.36 
 
 
659 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  36.25 
 
 
764 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.23 
 
 
697 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  39.24 
 
 
407 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.66 
 
 
662 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  37.4 
 
 
619 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.88 
 
 
768 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.48 
 
 
757 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  38.08 
 
 
763 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  32.57 
 
 
640 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.4 
 
 
656 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.92 
 
 
638 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.92 
 
 
638 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.2 
 
 
510 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  36.84 
 
 
577 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.92 
 
 
638 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 
810 aa  143  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.92 
 
 
638 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  35.51 
 
 
584 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.86 
 
 
642 aa  142  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  38.76 
 
 
405 aa  142  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  34.6 
 
 
699 aa  142  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  32.13 
 
 
638 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.47 
 
 
754 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.43 
 
 
643 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  35.66 
 
 
394 aa  142  9e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.46 
 
 
640 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.46 
 
 
642 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.46 
 
 
642 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.78 
 
 
805 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.1 
 
 
673 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.43 
 
 
648 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.1 
 
 
673 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  35.1 
 
 
584 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.6 
 
 
643 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.6 
 
 
638 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.66 
 
 
645 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.11 
 
 
742 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.94 
 
 
760 aa  141  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.11 
 
 
810 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.5 
 
 
743 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.57 
 
 
640 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.57 
 
 
640 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.75 
 
 
667 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  36.14 
 
 
663 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.72 
 
 
742 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  36.05 
 
 
638 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  37.74 
 
 
410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  39.35 
 
 
746 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.4 
 
 
651 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  35.46 
 
 
667 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.55 
 
 
754 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  37.66 
 
 
436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  34.69 
 
 
584 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.5 
 
 
740 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  38.32 
 
 
713 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.06 
 
 
638 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  34.45 
 
 
403 aa  139  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  38.1 
 
 
739 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  36.96 
 
 
407 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.93 
 
 
628 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  36.73 
 
 
646 aa  139  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  35.71 
 
 
406 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.11 
 
 
740 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.93 
 
 
628 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  33.08 
 
 
637 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  33.08 
 
 
637 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  33.86 
 
 
628 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  34.38 
 
 
681 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.11 
 
 
754 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  38.46 
 
 
405 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  35.06 
 
 
632 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.32 
 
 
631 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.78 
 
 
685 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.99 
 
 
645 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  35.42 
 
 
639 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.36 
 
 
739 aa  138  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  35.86 
 
 
804 aa  138  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>