More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2996 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  100 
 
 
478 aa  989    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  56.18 
 
 
448 aa  528  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  50.9 
 
 
450 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  46.95 
 
 
466 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  46.05 
 
 
432 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  45.15 
 
 
448 aa  392  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  42.61 
 
 
459 aa  353  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  40.5 
 
 
442 aa  347  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  44.21 
 
 
434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  40.09 
 
 
478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  39.82 
 
 
450 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  40.09 
 
 
450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  39.24 
 
 
441 aa  306  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  45.95 
 
 
744 aa  213  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  46.59 
 
 
743 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  44.79 
 
 
652 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  41.31 
 
 
787 aa  206  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  45.91 
 
 
788 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  45.17 
 
 
656 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  45.17 
 
 
680 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  42.19 
 
 
444 aa  193  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  45.02 
 
 
619 aa  192  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  42.47 
 
 
697 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  41.25 
 
 
682 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  43.3 
 
 
671 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  40.32 
 
 
725 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  39.78 
 
 
1085 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  43.57 
 
 
665 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  43.75 
 
 
653 aa  186  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  40.31 
 
 
689 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  45.89 
 
 
646 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  43.75 
 
 
639 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  43.28 
 
 
657 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  41.08 
 
 
656 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  48.8 
 
 
687 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  42.74 
 
 
634 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  45.24 
 
 
662 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  45.13 
 
 
725 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 
450 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  34.68 
 
 
1193 aa  176  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  40 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  41.13 
 
 
698 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  37.93 
 
 
749 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  38.3 
 
 
622 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  43.15 
 
 
678 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  55.56 
 
 
134 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  43.1 
 
 
697 aa  144  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  35.98 
 
 
578 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  33.18 
 
 
570 aa  133  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  33.64 
 
 
570 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  33.64 
 
 
570 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  33.64 
 
 
570 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  33.47 
 
 
299 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  32.82 
 
 
577 aa  128  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  33.87 
 
 
352 aa  127  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  29.84 
 
 
569 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  35.66 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  28.79 
 
 
580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  34.21 
 
 
305 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  35.27 
 
 
617 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  39.23 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  36.54 
 
 
443 aa  110  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.98 
 
 
477 aa  107  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  32.27 
 
 
348 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  35.63 
 
 
228 aa  103  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  38.15 
 
 
308 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  32.99 
 
 
439 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60303  predicted protein  31.84 
 
 
433 aa  102  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  31.3 
 
 
391 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
425 aa  101  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  32.38 
 
 
419 aa  101  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  37.1 
 
 
369 aa  99.4  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  36 
 
 
795 aa  99.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  31.38 
 
 
426 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  33.33 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  31.73 
 
 
451 aa  99  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  32.39 
 
 
332 aa  98.2  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  29.61 
 
 
326 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  32.26 
 
 
493 aa  97.1  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  33.83 
 
 
732 aa  96.7  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  30.54 
 
 
434 aa  96.7  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  39.6 
 
 
773 aa  96.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  39.6 
 
 
773 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  40.88 
 
 
771 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  33.91 
 
 
327 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  33.91 
 
 
327 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  30.8 
 
 
703 aa  94  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  33.53 
 
 
370 aa  94  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  39.29 
 
 
442 aa  94  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1088  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 
397 aa  93.6  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.05 
 
 
459 aa  94  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  39.16 
 
 
771 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30898  vacuolar protein  30.85 
 
 
422 aa  92.8  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  37.69 
 
 
335 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  32.26 
 
 
328 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  36.91 
 
 
336 aa  93.2  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  32.65 
 
 
327 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  30.94 
 
 
369 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  30.84 
 
 
436 aa  92.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  29.18 
 
 
810 aa  91.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>