More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1795 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  100 
 
 
1301 aa  2668    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  54.2 
 
 
1284 aa  1418    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.05 
 
 
611 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  35.94 
 
 
614 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.18 
 
 
643 aa  285  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.35 
 
 
632 aa  284  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.12 
 
 
635 aa  279  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.86 
 
 
612 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.75 
 
 
676 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  35.67 
 
 
619 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.63 
 
 
612 aa  275  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  34.42 
 
 
633 aa  275  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  34.42 
 
 
633 aa  275  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  34.42 
 
 
633 aa  275  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  34.42 
 
 
633 aa  275  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  34.42 
 
 
633 aa  275  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  34.42 
 
 
633 aa  275  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.13 
 
 
639 aa  274  7e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  35.27 
 
 
608 aa  274  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.81 
 
 
671 aa  274  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  33.99 
 
 
633 aa  272  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  36.53 
 
 
602 aa  272  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  33.99 
 
 
633 aa  271  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.62 
 
 
636 aa  271  7e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  37.28 
 
 
652 aa  271  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.96 
 
 
639 aa  270  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.97 
 
 
697 aa  270  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  33.91 
 
 
633 aa  269  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.91 
 
 
633 aa  270  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.97 
 
 
697 aa  270  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  35.84 
 
 
646 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  35.92 
 
 
665 aa  269  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.82 
 
 
660 aa  269  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.03 
 
 
652 aa  268  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.41 
 
 
617 aa  268  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.75 
 
 
616 aa  268  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  34.82 
 
 
700 aa  267  8e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.53 
 
 
604 aa  267  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35 
 
 
608 aa  266  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.59 
 
 
635 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.3 
 
 
637 aa  266  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  35.59 
 
 
635 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.36 
 
 
656 aa  266  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.27 
 
 
621 aa  266  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  34.52 
 
 
617 aa  265  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.65 
 
 
634 aa  266  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.24 
 
 
615 aa  265  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.59 
 
 
635 aa  265  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.3 
 
 
619 aa  265  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.59 
 
 
701 aa  265  4.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  35.94 
 
 
617 aa  265  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.68 
 
 
620 aa  265  6e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  35.94 
 
 
617 aa  264  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  34.78 
 
 
499 aa  264  8e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  35.94 
 
 
617 aa  264  8e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.69 
 
 
660 aa  264  8e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.35 
 
 
616 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  36.44 
 
 
616 aa  263  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.35 
 
 
616 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  35.35 
 
 
693 aa  264  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.78 
 
 
656 aa  263  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.71 
 
 
599 aa  263  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.85 
 
 
630 aa  262  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.97 
 
 
617 aa  262  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.63 
 
 
601 aa  262  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  35.71 
 
 
619 aa  262  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.63 
 
 
601 aa  262  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  34.68 
 
 
613 aa  262  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.67 
 
 
657 aa  262  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  36.22 
 
 
617 aa  262  4e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00158  cell division protease FtsH  34.6 
 
 
646 aa  261  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.14 
 
 
636 aa  261  6e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  35.67 
 
 
625 aa  261  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.71 
 
 
602 aa  261  6e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3548  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.93 
 
 
682 aa  261  6e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555196  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.4 
 
 
636 aa  261  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  33.11 
 
 
641 aa  261  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  34.68 
 
 
613 aa  261  8e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.39 
 
 
626 aa  260  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  35.63 
 
 
615 aa  260  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.96 
 
 
651 aa  260  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.44 
 
 
640 aa  260  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.68 
 
 
618 aa  260  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34 
 
 
645 aa  260  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  35.43 
 
 
645 aa  259  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.18 
 
 
662 aa  259  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.74 
 
 
640 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.74 
 
 
640 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.55 
 
 
697 aa  259  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  36.32 
 
 
662 aa  259  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  35.11 
 
 
613 aa  259  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  32.29 
 
 
642 aa  259  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.38 
 
 
644 aa  259  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.53 
 
 
599 aa  258  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.29 
 
 
640 aa  258  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  34.08 
 
 
616 aa  258  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.54 
 
 
577 aa  258  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  32.29 
 
 
639 aa  258  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.76 
 
 
613 aa  258  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.11 
 
 
640 aa  258  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>