More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5158 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5158  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 311 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0242102  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1826  ATPase central domain-containing protein  67.56 
 
 		 307 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2342  AAA ATPase, central region  64.46 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434105  unclonable  0.000000175529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1267  ATPase central domain-containing protein  64.46 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6929  AAA ATPase central domain protein  50.54 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00438766  hitchhiker  0.00101304 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00690  regulation of meiosis-related protein, putative  39.09 
 
 		 578 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_3211  predicted protein  35.07 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.713787  normal  0.107515 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13779  predicted protein  32.6 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 		 754 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  29.93 
 
 		 464 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  29.63 
 
 		 703 aa  87  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.18 
 
 		 757 aa  87  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30898  vacuolar protein  28.87 
 
 		 422 aa  86.7  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.18 
 
 		 754 aa  85.9  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3546  ATPase central domain-containing protein  31.22 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  31.67 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  32.12 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.83 
 
 		 754 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  31.22 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  32.04 
 
 		 747 aa  82.4  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.2 
 
 		 738 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.42 
 
 		 732 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  30.58 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  28.45 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28 
 
 		 736 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  30.66 
 
 		 866 aa  80.5  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.41 
 
 		 727 aa  80.5  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0583  vesicle-fusing ATPase  34.92 
 
 		 741 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0592  vesicle-fusing ATPase  34.92 
 
 		 741 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524368  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0605  vesicle-fusing ATPase  34.92 
 
 		 741 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.83 
 
 		 763 aa  79.3  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.95 
 
 		 768 aa  79.3  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.8 
 
 		 737 aa  79  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60303  predicted protein  28.33 
 
 		 433 aa  79  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  31.15 
 
 		 703 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.8 
 
 		 737 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4641  ATPase central domain-containing protein  31.02 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.44 
 
 		 731 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  30.1 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  30.54 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  30.72 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  28.51 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  30.7 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  32.2 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.14 
 
 		 754 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  31.52 
 
 		 567 aa  76.6  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86369  member of the AAA ATPase family of proteins  29.51 
 
 		 810 aa  77  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.435802 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.91 
 
 		 731 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.24 
 
 		 719 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  32.89 
 
 		 451 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  35.92 
 
 		 699 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  27.08 
 
 		 1301 aa  75.9  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  28.37 
 
 		 620 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.14 
 
 		 723 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  28.22 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  28.57 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  24.12 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  30.13 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.79 
 
 		 759 aa  74.7  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  29.76 
 
 		 550 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.1 
 
 		 808 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.63 
 
 		 760 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.31 
 
 		 801 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.51 
 
 		 852 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.09 
 
 		 718 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  29.87 
 
 		 718 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  29.07 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0648  AAA ATPase central domain protein  29.88 
 
 		 585 aa  73.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  28.52 
 
 		 713 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30 
 
 		 701 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.68 
 
 		 772 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  31.62 
 
 		 639 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.52 
 
 		 731 aa  72.8  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  35.15 
 
 		 776 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  29.57 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  30.94 
 
 		 754 aa  72.4  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  28.62 
 
 		 784 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.11 
 
 		 800 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  30.54 
 
 		 407 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  32.35 
 
 		 728 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  30 
 
 		 613 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  25.38 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.96 
 
 		 740 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  31.53 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30 
 
 		 731 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 810 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  29.13 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  26.44 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  32.28 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  25.35 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  26.24 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38163  predicted protein  28.87 
 
 		 800 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158186  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  28.76 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  29.91 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0155  vesicle-fusing ATPase  33.61 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  31.32 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  27.62 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  31.69 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  35 
 
 		 734 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0749  vesicle-fusing ATPase  32.28 
 
 		 742 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>