More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86369 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_86369  member of the AAA ATPase family of proteins  100 
 
 		 810 aa  1659    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.435802 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03691  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12560)  71.57 
 
 		 803 aa  457  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60303  predicted protein  42.41 
 
 		 433 aa  259  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_2208  predicted protein  47.83 
 
 		 303 aa  259  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_6399  predicted protein  45.58 
 
 		 290 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458224  normal  0.109876 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  40.52 
 
 		 439 aa  253  9.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  42.41 
 
 		 434 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30898  vacuolar protein  43.57 
 
 		 422 aa  249  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  41.37 
 
 		 442 aa  237  6e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  42 
 
 		 369 aa  211  6e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30513  predicted protein  38.74 
 
 		 408 aa  196  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.436051  normal  0.665929 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  39.53 
 
 		 367 aa  195  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04040  ATPase, putative  40.99 
 
 		 370 aa  188  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.22 
 
 		 721 aa  188  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.7 
 
 		 731 aa  188  4e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.9 
 
 		 731 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07047  membrane-spanning ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03990)  41.01 
 
 		 410 aa  185  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9005  predicted protein  36.96 
 
 		 337 aa  185  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299979  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1088  ATPase central domain-containing protein  36.03 
 
 		 397 aa  185  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.75 
 
 		 732 aa  182  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.99 
 
 		 731 aa  181  4e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.73 
 
 		 736 aa  180  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.88 
 
 		 808 aa  178  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.54 
 
 		 731 aa  177  8e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  35.91 
 
 		 754 aa  177  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.23 
 
 		 738 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.9 
 
 		 737 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.28 
 
 		 736 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.09 
 
 		 760 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.35 
 
 		 718 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.28 
 
 		 735 aa  174  5e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.04 
 
 		 768 aa  172  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.65 
 
 		 739 aa  172  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.24 
 
 		 759 aa  171  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.68 
 
 		 737 aa  171  4e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.54 
 
 		 769 aa  170  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.71 
 
 		 723 aa  170  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41501  predicted protein  37.2 
 
 		 449 aa  170  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364066  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.16 
 
 		 852 aa  169  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.26 
 
 		 754 aa  169  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.59 
 
 		 800 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.07 
 
 		 754 aa  168  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 		 742 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.55 
 
 		 743 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.28 
 
 		 781 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.91 
 
 		 781 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 		 810 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.12 
 
 		 742 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.62 
 
 		 704 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.2 
 
 		 738 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.96 
 
 		 784 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.38 
 
 		 755 aa  163  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33873  40 kDa putative membrane-spanning ATPase  38 
 
 		 357 aa  162  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.767325  normal  0.0397668 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.48 
 
 		 727 aa  162  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.34 
 
 		 757 aa  162  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  33.12 
 
 		 552 aa  161  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.74 
 
 		 719 aa  161  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.36 
 
 		 740 aa  161  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  36.27 
 
 		 788 aa  161  6e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  32.76 
 
 		 804 aa  160  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.48 
 
 		 773 aa  160  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.98 
 
 		 757 aa  160  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  36.63 
 
 		 703 aa  160  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.66 
 
 		 715 aa  160  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  37.29 
 
 		 764 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  35.32 
 
 		 394 aa  159  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  34.87 
 
 		 775 aa  159  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  38.54 
 
 		 763 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.72 
 
 		 740 aa  157  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.98 
 
 		 806 aa  157  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  36.84 
 
 		 829 aa  157  7e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  39.86 
 
 		 806 aa  157  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.17 
 
 		 709 aa  157  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  35.69 
 
 		 464 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.65 
 
 		 757 aa  156  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.37 
 
 		 756 aa  157  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.85 
 
 		 754 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  34 
 
 		 718 aa  155  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  40.17 
 
 		 412 aa  156  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  37.89 
 
 		 436 aa  155  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.37 
 
 		 754 aa  154  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  35.94 
 
 		 713 aa  154  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.12 
 
 		 805 aa  154  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  37.39 
 
 		 404 aa  154  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3258  AAA ATPase central domain protein  33.44 
 
 		 412 aa  154  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69388  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  36.71 
 
 		 410 aa  154  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.35 
 
 		 804 aa  153  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  33.02 
 
 		 814 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  36.3 
 
 		 732 aa  153  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.6 
 
 		 801 aa  152  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.52 
 
 		 801 aa  152  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.75 
 
 		 701 aa  152  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  32.18 
 
 		 810 aa  151  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01640  ATPase, putative  39.82 
 
 		 1159 aa  150  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.68 
 
 		 772 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  36.78 
 
 		 393 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4641  ATPase central domain-containing protein  35.42 
 
 		 446 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  31.95 
 
 		 389 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  33.33 
 
 		 756 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  35.86 
 
 		 410 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>