More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2342 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2342  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 304 aa  617  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434105  unclonable  0.000000175529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1267  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 304 aa  617  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1826  ATPase central domain-containing protein  69.39 
 
 		 307 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5158  AAA ATPase, central region  66.3 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0242102  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6929  AAA ATPase central domain protein  45.7 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00438766  hitchhiker  0.00101304 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00690  regulation of meiosis-related protein, putative  38.03 
 
 		 578 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13779  predicted protein  32.73 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_3211  predicted protein  32.35 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.713787  normal  0.107515 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0648  AAA ATPase central domain protein  30.82 
 
 		 585 aa  82  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  29.51 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.41 
 
 		 723 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.76 
 
 		 763 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.98 
 
 		 727 aa  79.3  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.73 
 
 		 757 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.39 
 
 		 754 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  31.03 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30898  vacuolar protein  30.63 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.2 
 
 		 781 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.48 
 
 		 754 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  27.15 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  29.36 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  27.84 
 
 		 703 aa  75.5  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  34.04 
 
 		 613 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  29.94 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  30.93 
 
 		 703 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  29.06 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  28.77 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  30.5 
 
 		 764 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.65 
 
 		 852 aa  74.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4641  ATPase central domain-containing protein  30.88 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  28.71 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.2 
 
 		 754 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  32.66 
 
 		 829 aa  74.7  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  30 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  29.36 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  27.91 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  27.18 
 
 		 814 aa  73.6  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  33.76 
 
 		 699 aa  73.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  31.4 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  27.46 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.3 
 
 		 754 aa  72.8  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.74 
 
 		 732 aa  72.4  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.34 
 
 		 781 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  30.43 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  28.09 
 
 		 810 aa  71.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  29.21 
 
 		 763 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  30.57 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3546  ATPase central domain-containing protein  30.43 
 
 		 443 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  32.74 
 
 		 754 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.57 
 
 		 772 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  35.67 
 
 		 776 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  30.77 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.85 
 
 		 756 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.85 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.3 
 
 		 737 aa  70.5  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1787  AAA ATPase family protein  30.2 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  31.1 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.21 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  28.08 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.3 
 
 		 736 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.66 
 
 		 738 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.3 
 
 		 737 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  25 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1088  ATPase central domain-containing protein  29.33 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  31.1 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  30.43 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  31.02 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  28.22 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.93 
 
 		 773 aa  70.1  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.31 
 
 		 718 aa  70.1  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.59 
 
 		 800 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  30.3 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.21 
 
 		 808 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60303  predicted protein  29.34 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.59 
 
 		 784 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  31.1 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  32.1 
 
 		 866 aa  69.7  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  32.62 
 
 		 639 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  34.72 
 
 		 747 aa  69.3  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.85 
 
 		 757 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0500  AAA family ATPase  26.85 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0781793  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  28.22 
 
 		 410 aa  69.3  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  31.64 
 
 		 412 aa  69.3  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  31.85 
 
 		 691 aa  69.3  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  31.94 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  31.21 
 
 		 422 aa  69.3  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.94 
 
 		 806 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.43 
 
 		 709 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  24.49 
 
 		 804 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86369  member of the AAA ATPase family of proteins  30 
 
 		 810 aa  68.9  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.435802 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  27.49 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.5 
 
 		 701 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  26.11 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.46 
 
 		 715 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.29 
 
 		 768 aa  68.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  27.35 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  30.46 
 
 		 1301 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  29.39 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.67 
 
 		 736 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 		 810 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>