39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31398 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  100 
 
 
455 aa  925    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  65.13 
 
 
458 aa  632  1e-180  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  65.84 
 
 
459 aa  618  1e-176  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  63.6 
 
 
484 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  60.09 
 
 
485 aa  543  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  42.29 
 
 
450 aa  366  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  42.79 
 
 
448 aa  361  2e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  41.63 
 
 
451 aa  360  4e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  42.95 
 
 
450 aa  360  4e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  40.97 
 
 
451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  42.89 
 
 
484 aa  356  3.9999999999999996e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  43.31 
 
 
441 aa  351  2e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  39.96 
 
 
462 aa  347  3e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  40.9 
 
 
456 aa  343  5e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  40.77 
 
 
463 aa  341  1e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  38.6 
 
 
468 aa  338  9e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  40.09 
 
 
451 aa  331  2e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  39.95 
 
 
452 aa  319  7.999999999999999e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.739423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  41.69 
 
 
452 aa  311  2e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  28.83 
 
 
514 aa  50.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  32.62 
 
 
900 aa  48.9  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32 
 
 
586 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.63 
 
 
522 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.57 
 
 
562 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  41.51 
 
 
349 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.15 
 
 
554 aa  43.5  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.89 
 
 
562 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.89 
 
 
562 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1538  Holliday junction DNA helicase RuvB  43.4 
 
 
313 aa  43.5  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0672252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.24 
 
 
651 aa  43.1  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.68 
 
 
639 aa  43.5  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.89 
 
 
562 aa  43.1  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.89 
 
 
562 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.89 
 
 
562 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.89 
 
 
562 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.94 
 
 
638 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.89 
 
 
562 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.68 
 
 
642 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.68 
 
 
651 aa  43.1  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>