More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0616 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  88.2 
 
 		 450 aa  797    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  87.97 
 
 		 451 aa  805    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  100 
 
 		 450 aa  885    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  85.75 
 
 		 451 aa  786    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  67.84 
 
 		 456 aa  629  1e-179  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  58.45 
 
 		 441 aa  509  1e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  52.99 
 
 		 452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.739423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  54.52 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  48.76 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  46.49 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  42.29 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  42.67 
 
 		 484 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  42.54 
 
 		 459 aa  352  7e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  41.57 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  42.53 
 
 		 463 aa  349  7e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  42.34 
 
 		 484 aa  349  7e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  41.19 
 
 		 485 aa  343  2.9999999999999997e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  40.23 
 
 		 468 aa  334  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  38.31 
 
 		 451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 731 aa  52  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.33 
 
 		 731 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.91 
 
 		 732 aa  50.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 		 731 aa  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 		 731 aa  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 		 628 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  41.18 
 
 		 630 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 		 628 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 		 781 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  37.88 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  41.18 
 
 		 637 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 		 781 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  41.49 
 
 		 644 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 		 800 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 		 784 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.88 
 
 		 759 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  41.94 
 
 		 567 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.36 
 
 		 577 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  37.5 
 
 		 584 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  41.86 
 
 		 630 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.83 
 
 		 646 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3521  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.67 
 
 		 347 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.16 
 
 		 631 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  40 
 
 		 628 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.83 
 
 		 646 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1029  ATPase central domain-containing protein  28.85 
 
 		 583 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  60.47 
 
 		 637 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.47 
 
 		 645 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.52 
 
 		 768 aa  48.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  60.47 
 
 		 637 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.78 
 
 		 651 aa  47.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  60.47 
 
 		 637 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.71 
 
 		 640 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.71 
 
 		 640 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.44 
 
 		 662 aa  47.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  39.53 
 
 		 692 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  60.47 
 
 		 637 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.09 
 
 		 769 aa  47.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.65 
 
 		 676 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  36.36 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  40.98 
 
 		 810 aa  47.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  60.47 
 
 		 645 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  36.36 
 
 		 584 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.56 
 
 		 584 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52 
 
 		 616 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.17 
 
 		 723 aa  47.4  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.47 
 
 		 701 aa  47.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 		 628 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86369  member of the AAA ATPase family of proteins  35.16 
 
 		 810 aa  47  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.435802 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  52.17 
 
 		 317 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  42.86 
 
 		 628 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  43.21 
 
 		 665 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.06 
 
 		 630 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0979  FtsH peptidase  40.43 
 
 		 641 aa  47  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  40.96 
 
 		 650 aa  47.4  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  40.96 
 
 		 647 aa  47.4  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.06 
 
 		 697 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  58.14 
 
 		 667 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  55.81 
 
 		 613 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  55.81 
 
 		 619 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.81 
 
 		 616 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.18 
 
 		 623 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.66 
 
 		 697 aa  47  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45 
 
 		 738 aa  47  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.81 
 
 		 616 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  55.81 
 
 		 613 aa  47  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  44.29 
 
 		 632 aa  47  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 		 632 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0723  FtsH-2 peptidase  52 
 
 		 609 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0513277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.22 
 
 		 637 aa  47  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.67 
 
 		 735 aa  47  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52 
 
 		 618 aa  47  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  42.31 
 
 		 584 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.66 
 
 		 697 aa  47  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.81 
 
 		 612 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.54 
 
 		 608 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.98 
 
 		 760 aa  47  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  41.56 
 
 		 640 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1292  Holliday junction DNA helicase RuvB  50 
 
 		 349 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.81 
 
 		 616 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  55.81 
 
 		 617 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>