107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00990 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  100 
 
 		 484 aa  974    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  67.76 
 
 		 458 aa  625  1e-178  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  67.04 
 
 		 459 aa  614  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  63.6 
 
 		 455 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  57.41 
 
 		 485 aa  545  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  43.78 
 
 		 450 aa  364  2e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  42.83 
 
 		 463 aa  363  3e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  42.67 
 
 		 450 aa  362  8e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  41.59 
 
 		 451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  43.58 
 
 		 441 aa  355  1e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  41.7 
 
 		 448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  42.09 
 
 		 451 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  39.78 
 
 		 462 aa  352  7e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  40.47 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  41.32 
 
 		 484 aa  347  4e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  40.49 
 
 		 456 aa  343  5.999999999999999e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  39.74 
 
 		 451 aa  323  5e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  39.38 
 
 		 452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.739423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  40.09 
 
 		 452 aa  298  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.81 
 
 		 460 aa  53.5  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1557  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.84 
 
 		 543 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.311213  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.59 
 
 		 731 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.59 
 
 		 731 aa  49.3  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.08 
 
 		 939 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  27.1 
 
 		 552 aa  48.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.9 
 
 		 731 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86905  cytoplasmic protein involved in protein transport between ER and Golgi ATPase  44.64 
 
 		 794 aa  47.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.9 
 
 		 731 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  25.5 
 
 		 691 aa  47  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  67.57 
 
 		 642 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.89 
 
 		 730 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.31 
 
 		 921 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1135  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.77 
 
 		 650 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239786  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  29 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  33.33 
 
 		 601 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.73 
 
 		 690 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  30.82 
 
 		 529 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.05 
 
 		 685 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  64.86 
 
 		 639 aa  45.1  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  64.86 
 
 		 632 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.27 
 
 		 732 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0830  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.92 
 
 		 580 aa  45.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  29.41 
 
 		 703 aa  45.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.34 
 
 		 554 aa  45.1  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.05 
 
 		 678 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  50 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0885717 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.27 
 
 		 759 aa  44.3  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  31.72 
 
 		 803 aa  44.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  50.88 
 
 		 613 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.16 
 
 		 768 aa  44.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.71 
 
 		 735 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.76 
 
 		 681 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0063  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.71 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.389593  normal  0.914826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0062  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.71 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  42.42 
 
 		 348 aa  44.3  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.64 
 
 		 367 aa  44.3  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  60.53 
 
 		 769 aa  44.3  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.75 
 
 		 760 aa  44.3  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0275  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.09 
 
 		 553 aa  44.3  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.01799  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.78 
 
 		 644 aa  44.3  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  62.16 
 
 		 640 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.71 
 
 		 717 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.71 
 
 		 713 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  62.16 
 
 		 640 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  50.82 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  47.17 
 
 		 353 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  58 
 
 		 784 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.84 
 
 		 769 aa  43.9  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  62.16 
 
 		 638 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.64 
 
 		 781 aa  43.9  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.95 
 
 		 517 aa  43.9  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.16 
 
 		 625 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.18 
 
 		 662 aa  43.9  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  59.46 
 
 		 632 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  50 
 
 		 599 aa  43.5  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.46 
 
 		 631 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.46 
 
 		 631 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.64 
 
 		 800 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.64 
 
 		 781 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.46 
 
 		 631 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.46 
 
 		 631 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.89 
 
 		 629 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.46 
 
 		 628 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.46 
 
 		 628 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  57.89 
 
 		 628 aa  43.5  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  59.46 
 
 		 627 aa  43.5  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  57.89 
 
 		 629 aa  43.5  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.46 
 
 		 627 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  62.86 
 
 		 637 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.64 
 
 		 784 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.46 
 
 		 631 aa  43.5  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  41.51 
 
 		 348 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.89 
 
 		 629 aa  43.5  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  59.46 
 
 		 628 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  59.46 
 
 		 628 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  59.46 
 
 		 628 aa  43.5  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.46 
 
 		 649 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.86 
 
 		 701 aa  43.1  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  59.46 
 
 		 628 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.46 
 
 		 628 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>