More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86905 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_86905  cytoplasmic protein involved in protein transport between ER and Golgi ATPase  100 
 
 
794 aa  1613    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04190  vesicular-fusion protein sec18, putative  45.31 
 
 
844 aa  627  1e-178  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30476  predicted protein  42.36 
 
 
737 aa  521  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.59852  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03098  vesicular fusion ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12510)  39.12 
 
 
775 aa  508  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166413  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12620  predicted protein  49.42 
 
 
532 aa  483  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41487  predicted protein  42.06 
 
 
550 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00314101  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_3366  predicted protein  56.57 
 
 
225 aa  239  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.851714  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.23 
 
 
738 aa  208  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.92 
 
 
730 aa  205  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
719 aa  201  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.64 
 
 
739 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  32.78 
 
 
739 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.71 
 
 
740 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.58 
 
 
727 aa  198  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.77 
 
 
718 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  34.92 
 
 
776 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.92 
 
 
754 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.99 
 
 
723 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.17 
 
 
754 aa  197  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.99 
 
 
715 aa  197  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.18 
 
 
757 aa  196  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.51 
 
 
759 aa  196  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  33.25 
 
 
754 aa  195  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.03 
 
 
806 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.48 
 
 
731 aa  194  5e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  30.4 
 
 
699 aa  194  7e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.15 
 
 
740 aa  193  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 
810 aa  193  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.26 
 
 
742 aa  192  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.48 
 
 
731 aa  192  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.75 
 
 
731 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.62 
 
 
808 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.67 
 
 
760 aa  191  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.32 
 
 
754 aa  192  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.42 
 
 
743 aa  191  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.84 
 
 
721 aa  191  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.91 
 
 
732 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  32.3 
 
 
746 aa  190  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.5 
 
 
701 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  32.84 
 
 
713 aa  189  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.66 
 
 
805 aa  189  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  31.66 
 
 
764 aa  188  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  32.84 
 
 
703 aa  188  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  33.25 
 
 
722 aa  188  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.17 
 
 
742 aa  188  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
756 aa  188  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42768  predicted protein  38.67 
 
 
599 aa  187  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.49 
 
 
768 aa  187  6e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.22 
 
 
731 aa  187  7e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.6 
 
 
754 aa  187  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.17 
 
 
810 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.47 
 
 
757 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  28.93 
 
 
703 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  32.15 
 
 
718 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.83 
 
 
801 aa  185  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
805 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.11 
 
 
757 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.09 
 
 
769 aa  184  6e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.78 
 
 
755 aa  184  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.68 
 
 
804 aa  184  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  32.17 
 
 
763 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.19 
 
 
736 aa  180  9e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.18 
 
 
738 aa  180  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.49 
 
 
704 aa  178  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  30.69 
 
 
647 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.28 
 
 
735 aa  177  7e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  32.49 
 
 
601 aa  177  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.36 
 
 
763 aa  176  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  32.3 
 
 
613 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.18 
 
 
773 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.57 
 
 
709 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
826 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  29.82 
 
 
721 aa  174  6.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  31.06 
 
 
639 aa  173  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.65 
 
 
737 aa  173  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13383  predicted protein  51.5 
 
 
164 aa  172  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.03 
 
 
736 aa  172  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  30.66 
 
 
732 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.78 
 
 
781 aa  171  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.59 
 
 
753 aa  171  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.75 
 
 
772 aa  171  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.51 
 
 
801 aa  170  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  37.91 
 
 
829 aa  169  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.23 
 
 
800 aa  168  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.25 
 
 
738 aa  168  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.45 
 
 
781 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  32.33 
 
 
775 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  29.63 
 
 
806 aa  167  6.9999999999999995e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.32 
 
 
737 aa  167  8e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  37.21 
 
 
804 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.58 
 
 
784 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  35.93 
 
 
390 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  32.88 
 
 
788 aa  164  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  30.6 
 
 
685 aa  164  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  31.58 
 
 
803 aa  161  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.33 
 
 
852 aa  162  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  29.17 
 
 
810 aa  161  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  38.91 
 
 
412 aa  159  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  29.97 
 
 
814 aa  158  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  36.67 
 
 
513 aa  157  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>