More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1371 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 348 aa  664    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  86.78 
 
 		 353 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.89 
 
 		 367 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.22 
 
 		 366 aa  475  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1810  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.4 
 
 		 354 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2267  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.05 
 
 		 357 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.48 
 
 		 370 aa  471  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2111  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.55 
 
 		 353 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00345242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2306  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.05 
 
 		 357 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2314  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.05 
 
 		 357 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1800  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.81 
 
 		 354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383421  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6111  Holliday junction DNA helicase B  70.5 
 
 		 352 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0830946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3824  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.97 
 
 		 357 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.265234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2575  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.88 
 
 		 355 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.47 
 
 		 349 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  70.52 
 
 		 374 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.48 
 
 		 337 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12612  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.53 
 
 		 344 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2302  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.49 
 
 		 363 aa  455  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.43 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.04 
 
 		 368 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1936  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.58 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3826  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.17 
 
 		 359 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0702287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17530  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  70.96 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.200391 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.6 
 
 		 360 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.37 
 
 		 351 aa  448  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.64 
 
 		 355 aa  450  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.66 
 
 		 382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2301  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.83 
 
 		 362 aa  441  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171399  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1668  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.43 
 
 		 367 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1796  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.39 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.116666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2031  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.12 
 
 		 361 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000121008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12880  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.83 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.579747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15320  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  66.67 
 
 		 357 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.280238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1994  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.58 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13960  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  66.87 
 
 		 353 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.91 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.75 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.35 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.71 
 
 		 342 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.94 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.12 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.43 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.81 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.62 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.89 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.63 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.33 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.82 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.33 
 
 		 363 aa  381  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.28 
 
 		 341 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.8 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.22 
 
 		 346 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.77 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.63 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.02 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.31 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1215  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.64 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.423128  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.33 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.27 
 
 		 338 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.28 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.36 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.66 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.1 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.63 
 
 		 356 aa  378  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.3 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.71 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.75 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.96 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.31 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.61 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.75 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.89 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.72 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.71 
 
 		 340 aa  372  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0453  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00906919  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.59 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>