More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1796 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1796  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
359 aa  681    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.116666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17530  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  84.87 
 
 
355 aa  541  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.200391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1668  Holliday junction DNA helicase RuvB  85.59 
 
 
367 aa  525  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  81.31 
 
 
352 aa  519  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1994  Holliday junction DNA helicase RuvB  79.65 
 
 
345 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.12 
 
 
355 aa  492  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2031  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.87 
 
 
361 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000121008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2301  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.94 
 
 
362 aa  481  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171399  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.3 
 
 
360 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2111  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.73 
 
 
353 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00345242  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12880  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.64 
 
 
340 aa  468  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.579747  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13960  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  77.71 
 
 
353 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.19 
 
 
382 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.54 
 
 
351 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.49 
 
 
337 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.39 
 
 
367 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6111  Holliday junction DNA helicase B  72.48 
 
 
352 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0830946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.39 
 
 
348 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.7 
 
 
353 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.22 
 
 
349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.67 
 
 
370 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2306  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.52 
 
 
357 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3824  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.25 
 
 
357 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.265234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2267  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.52 
 
 
357 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2302  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.61 
 
 
363 aa  438  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2314  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.52 
 
 
357 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  68.69 
 
 
374 aa  434  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2575  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.94 
 
 
355 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1810  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.23 
 
 
354 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794577  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12612  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.66 
 
 
344 aa  432  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553587  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1800  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.25 
 
 
354 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383421  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15320  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  68.66 
 
 
357 aa  431  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.280238  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.21 
 
 
366 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.75 
 
 
368 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1936  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.16 
 
 
364 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3826  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.67 
 
 
359 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0702287  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.54 
 
 
353 aa  409  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0453  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.01 
 
 
348 aa  384  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00906919  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1215  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.63 
 
 
351 aa  374  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.423128  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3181  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 
338 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.41 
 
 
344 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  57.73 
 
 
346 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.92 
 
 
351 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 
335 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.39 
 
 
340 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.86 
 
 
345 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.31 
 
 
338 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 
336 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.58 
 
 
346 aa  364  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.9 
 
 
338 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.14 
 
 
358 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 
333 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.43 
 
 
345 aa  363  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.8 
 
 
336 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.36 
 
 
361 aa  362  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.66 
 
 
336 aa  362  6e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.73 
 
 
338 aa  362  8e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.94 
 
 
344 aa  362  8e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.06 
 
 
356 aa  361  9e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 
336 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.06 
 
 
356 aa  361  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.04 
 
 
351 aa  360  1e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.16 
 
 
338 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.84 
 
 
346 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.76 
 
 
342 aa  360  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.03 
 
 
354 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.13 
 
 
356 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 
355 aa  359  5e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  54.21 
 
 
342 aa  358  5e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.56 
 
 
347 aa  358  6e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.21 
 
 
339 aa  358  6e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
356 aa  358  7e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 
348 aa  358  8e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.53 
 
 
346 aa  358  8e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 
355 aa  358  9e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 
354 aa  358  9e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.42 
 
 
357 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 
330 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.1 
 
 
339 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.73 
 
 
338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.93 
 
 
338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.39 
 
 
343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.57 
 
 
338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2576  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 
326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0652542  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 
363 aa  357  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.45 
 
 
356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.98 
 
 
354 aa  355  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.37 
 
 
338 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.45 
 
 
343 aa  355  6.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 
353 aa  355  7.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.5 
 
 
345 aa  355  7.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.03 
 
 
341 aa  355  7.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.73 
 
 
351 aa  355  8.999999999999999e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.73 
 
 
351 aa  355  8.999999999999999e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0629  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.78 
 
 
339 aa  354  1e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.151039 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.85 
 
 
337 aa  354  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.69 
 
 
337 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.74 
 
 
344 aa  354  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 
344 aa  354  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>