More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07050 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  100 
 
 
346 aa  691    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  83.08 
 
 
342 aa  558  1e-158  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  79.48 
 
 
351 aa  551  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.42 
 
 
355 aa  483  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.38 
 
 
342 aa  434  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.69 
 
 
336 aa  434  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.31 
 
 
344 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.01 
 
 
335 aa  421  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.46 
 
 
339 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 
349 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.5 
 
 
336 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.11 
 
 
346 aa  417  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.88 
 
 
330 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  63.08 
 
 
349 aa  418  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.8 
 
 
336 aa  418  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.46 
 
 
349 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 
338 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.8 
 
 
346 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.11 
 
 
344 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.55 
 
 
337 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.42 
 
 
338 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.22 
 
 
345 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.73 
 
 
338 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 
337 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 
338 aa  408  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.13 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.62 
 
 
356 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.08 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.99 
 
 
341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 
333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.3 
 
 
354 aa  404  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.11 
 
 
337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.69 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 
354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.11 
 
 
337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 
333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.2 
 
 
541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.3 
 
 
354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.3 
 
 
356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.3 
 
 
356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.32 
 
 
357 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 
333 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.62 
 
 
354 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 
357 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 
333 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 
361 aa  401  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.51 
 
 
333 aa  401  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.8 
 
 
355 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.63 
 
 
334 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 
363 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 
357 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 
333 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 
333 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 
333 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 
343 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.34 
 
 
351 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 
345 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1215  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 
351 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.423128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.96 
 
 
332 aa  398  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.63 
 
 
337 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.51 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.9 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1324  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.54 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.211473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 
335 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
335 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  58.97 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.01 
 
 
363 aa  398  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0561  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.77 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.389647  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.11 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.86 
 
 
351 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.08 
 
 
334 aa  394  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.51 
 
 
358 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 
341 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
356 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.77 
 
 
355 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
356 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
353 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.64 
 
 
355 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 
337 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
356 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.9 
 
 
352 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
356 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 
334 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.72 
 
 
334 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.31 
 
 
350 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
356 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 
347 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>