More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2113 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
332 aa  659    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.97 
 
 
344 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.87 
 
 
333 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.54 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.87 
 
 
333 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  66.57 
 
 
541 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.87 
 
 
333 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
336 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
336 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
336 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.27 
 
 
333 aa  434  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
333 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  68 
 
 
336 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
333 aa  435  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.96 
 
 
333 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.87 
 
 
333 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.87 
 
 
333 aa  431  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.34 
 
 
342 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  65.34 
 
 
341 aa  425  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.72 
 
 
330 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  64 
 
 
335 aa  425  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.35 
 
 
338 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.75 
 
 
336 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.05 
 
 
338 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.94 
 
 
338 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.03 
 
 
346 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.53 
 
 
344 aa  419  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.53 
 
 
338 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.43 
 
 
349 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.94 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.36 
 
 
341 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.61 
 
 
338 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.5 
 
 
335 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.94 
 
 
349 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.92 
 
 
338 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.71 
 
 
341 aa  411  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.16 
 
 
336 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 
334 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  64.24 
 
 
349 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.85 
 
 
334 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.44 
 
 
345 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.35 
 
 
344 aa  411  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.91 
 
 
337 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.22 
 
 
337 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.22 
 
 
350 aa  408  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.02 
 
 
337 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 
336 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.54 
 
 
334 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.92 
 
 
334 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.92 
 
 
340 aa  411  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.12 
 
 
345 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.03 
 
 
351 aa  408  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.54 
 
 
334 aa  408  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.62 
 
 
335 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.89 
 
 
346 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.46 
 
 
335 aa  408  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.54 
 
 
334 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.85 
 
 
336 aa  408  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  61.82 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.92 
 
 
337 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.08 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  62.96 
 
 
346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.44 
 
 
353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.85 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.47 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.18 
 
 
337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.59 
 
 
346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.54 
 
 
351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.11 
 
 
347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.75 
 
 
339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  61.7 
 
 
336 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 
336 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.31 
 
 
348 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.31 
 
 
348 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 
334 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.82 
 
 
336 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 
334 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.31 
 
 
358 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 
334 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.84 
 
 
348 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 
336 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.82 
 
 
336 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 
336 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.63 
 
 
350 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.82 
 
 
336 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 
334 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.82 
 
 
336 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 
348 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 
348 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 
336 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 
336 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 
351 aa  401  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.01 
 
 
355 aa  401  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.82 
 
 
336 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.38 
 
 
347 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.46 
 
 
337 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.09 
 
 
337 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.7 
 
 
334 aa  401  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 
336 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>