More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4060 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 358 aa  709    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  81.5 
 
 		 351 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  80.23 
 
 		 354 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  79.67 
 
 		 363 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  79.66 
 
 		 355 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.93 
 
 		 352 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  82.23 
 
 		 341 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  80.35 
 
 		 355 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.75 
 
 		 357 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.75 
 
 		 357 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.93 
 
 		 356 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.93 
 
 		 356 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.93 
 
 		 356 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.93 
 
 		 356 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.93 
 
 		 356 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.93 
 
 		 356 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.93 
 
 		 356 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.93 
 
 		 356 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.62 
 
 		 357 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.01 
 
 		 354 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.8 
 
 		 356 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.9 
 
 		 347 aa  527  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  79.19 
 
 		 355 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  79.19 
 
 		 356 aa  527  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  79.19 
 
 		 355 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  79.19 
 
 		 356 aa  527  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  79.19 
 
 		 356 aa  527  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.46 
 
 		 354 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.31 
 
 		 345 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.66 
 
 		 354 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.26 
 
 		 354 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  79.09 
 
 		 361 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.79 
 
 		 363 aa  521  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.01 
 
 		 355 aa  518  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.74 
 
 		 356 aa  518  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.57 
 
 		 356 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.64 
 
 		 356 aa  519  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.86 
 
 		 356 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.02 
 
 		 354 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.9 
 
 		 356 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.93 
 
 		 358 aa  508  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.94 
 
 		 353 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.09 
 
 		 334 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.33 
 
 		 335 aa  492  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.65 
 
 		 334 aa  488  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.04 
 
 		 337 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  71.65 
 
 		 355 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.37 
 
 		 334 aa  484  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.12 
 
 		 334 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.29 
 
 		 334 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.29 
 
 		 334 aa  484  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.09 
 
 		 336 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.12 
 
 		 334 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.12 
 
 		 334 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.29 
 
 		 334 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.12 
 
 		 334 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.69 
 
 		 344 aa  485  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.17 
 
 		 334 aa  487  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.37 
 
 		 336 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  71 
 
 		 353 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.04 
 
 		 334 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.94 
 
 		 338 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.12 
 
 		 334 aa  482  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.23 
 
 		 338 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.39 
 
 		 335 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.82 
 
 		 334 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.12 
 
 		 334 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.47 
 
 		 337 aa  481  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.82 
 
 		 334 aa  482  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.17 
 
 		 345 aa  478  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.25 
 
 		 334 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.52 
 
 		 334 aa  480  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.79 
 
 		 336 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.21 
 
 		 351 aa  478  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.12 
 
 		 352 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.79 
 
 		 337 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.52 
 
 		 352 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.12 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.21 
 
 		 350 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.69 
 
 		 348 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.21 
 
 		 353 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.57 
 
 		 336 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.39 
 
 		 348 aa  474  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.39 
 
 		 348 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.39 
 
 		 348 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.05 
 
 		 337 aa  473  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.52 
 
 		 337 aa  473  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  71 
 
 		 348 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.21 
 
 		 334 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.39 
 
 		 336 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.7 
 
 		 336 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.39 
 
 		 336 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.6 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.29 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.57 
 
 		 348 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.39 
 
 		 336 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.39 
 
 		 336 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.7 
 
 		 336 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.39 
 
 		 336 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.39 
 
 		 336 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>