More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1662 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
344 aa  686    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.36 
 
 
336 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.48 
 
 
336 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.66 
 
 
541 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.66 
 
 
333 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.66 
 
 
336 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.66 
 
 
336 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.66 
 
 
336 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.66 
 
 
333 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.67 
 
 
342 aa  464  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.91 
 
 
344 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.66 
 
 
333 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.96 
 
 
333 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.66 
 
 
333 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.16 
 
 
333 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.16 
 
 
333 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.57 
 
 
336 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.75 
 
 
337 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.89 
 
 
338 aa  455  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.94 
 
 
338 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.75 
 
 
337 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
348 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.54 
 
 
338 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.28 
 
 
343 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.46 
 
 
333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.16 
 
 
345 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.38 
 
 
330 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.19 
 
 
349 aa  447  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.35 
 
 
335 aa  448  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.78 
 
 
349 aa  449  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.97 
 
 
353 aa  448  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.37 
 
 
333 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  65.78 
 
 
349 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.43 
 
 
338 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.44 
 
 
348 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.16 
 
 
341 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.46 
 
 
344 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.44 
 
 
350 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.44 
 
 
348 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.28 
 
 
338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.44 
 
 
348 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.53 
 
 
345 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.53 
 
 
337 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.2 
 
 
351 aa  443  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.72 
 
 
348 aa  442  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.21 
 
 
341 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.74 
 
 
338 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.22 
 
 
334 aa  441  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.61 
 
 
334 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.8 
 
 
335 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.42 
 
 
335 aa  442  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  63.69 
 
 
341 aa  441  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.2 
 
 
351 aa  443  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.79 
 
 
344 aa  441  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.01 
 
 
347 aa  441  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.3 
 
 
334 aa  441  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.64 
 
 
350 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.42 
 
 
336 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.11 
 
 
336 aa  438  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.55 
 
 
353 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.83 
 
 
358 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.22 
 
 
334 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.44 
 
 
352 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.24 
 
 
351 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.22 
 
 
334 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.92 
 
 
351 aa  438  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.8 
 
 
352 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.22 
 
 
334 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.85 
 
 
347 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.91 
 
 
336 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.91 
 
 
350 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.74 
 
 
353 aa  434  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.1 
 
 
347 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.65 
 
 
336 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.94 
 
 
352 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.53 
 
 
348 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.02 
 
 
363 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.47 
 
 
346 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
345 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.23 
 
 
351 aa  437  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.02 
 
 
339 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.41 
 
 
354 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.97 
 
 
332 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.39 
 
 
334 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.46 
 
 
347 aa  432  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.41 
 
 
355 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.61 
 
 
337 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.17 
 
 
346 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.42 
 
 
354 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  64.31 
 
 
346 aa  432  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1205  Holliday junction DNA helicase RuvB  63 
 
 
334 aa  428  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781696  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.3 
 
 
356 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.08 
 
 
334 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.33 
 
 
356 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.93 
 
 
354 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.33 
 
 
356 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.82 
 
 
346 aa  428  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.08 
 
 
334 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.39 
 
 
356 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1698  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.19 
 
 
334 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>