More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1431 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
344 aa  687    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.38 
 
 
336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.57 
 
 
335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.2 
 
 
342 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.79 
 
 
344 aa  441  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.3 
 
 
333 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.8 
 
 
541 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.06 
 
 
336 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.2 
 
 
341 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.3 
 
 
333 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.8 
 
 
336 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.8 
 
 
336 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.8 
 
 
336 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  63 
 
 
333 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.36 
 
 
330 aa  435  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  63 
 
 
333 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  63 
 
 
333 aa  435  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.23 
 
 
338 aa  431  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.43 
 
 
338 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.23 
 
 
338 aa  431  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.4 
 
 
336 aa  431  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.83 
 
 
333 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.3 
 
 
333 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.65 
 
 
339 aa  431  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.14 
 
 
333 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  63 
 
 
333 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.83 
 
 
346 aa  428  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.67 
 
 
338 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.37 
 
 
338 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.98 
 
 
337 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.83 
 
 
346 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.98 
 
 
337 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.27 
 
 
351 aa  421  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.88 
 
 
338 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.73 
 
 
345 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.22 
 
 
354 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  63.8 
 
 
341 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.2 
 
 
338 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 
357 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.54 
 
 
334 aa  418  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.03 
 
 
355 aa  418  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.76 
 
 
348 aa  418  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  60.92 
 
 
342 aa  420  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.88 
 
 
349 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.24 
 
 
350 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.24 
 
 
361 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 
349 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.35 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.96 
 
 
357 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.35 
 
 
336 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.04 
 
 
336 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.84 
 
 
358 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.96 
 
 
341 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.82 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.27 
 
 
356 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.14 
 
 
347 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  61.11 
 
 
346 aa  417  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.95 
 
 
356 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.84 
 
 
354 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.17 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.23 
 
 
334 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.82 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.27 
 
 
356 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.73 
 
 
335 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.23 
 
 
335 aa  416  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.54 
 
 
343 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.96 
 
 
357 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.54 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  62.28 
 
 
349 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.54 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.86 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.54 
 
 
334 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.54 
 
 
336 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 
354 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.23 
 
 
337 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 
354 aa  411  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.58 
 
 
352 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.87 
 
 
352 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.52 
 
 
348 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 
353 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.43 
 
 
356 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.23 
 
 
358 aa  411  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.35 
 
 
355 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 
363 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.53 
 
 
332 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.85 
 
 
355 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.23 
 
 
336 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.54 
 
 
334 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.49 
 
 
354 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.77 
 
 
363 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.23 
 
 
334 aa  411  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.41 
 
 
348 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.92 
 
 
334 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 
334 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.46 
 
 
344 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
335 aa  408  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.18 
 
 
350 aa  408  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.87 
 
 
334 aa  408  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.59 
 
 
348 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 
334 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>