More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0893 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 355 aa  719    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  68.42 
 
 		 346 aa  483  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  66.96 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.48 
 
 		 351 aa  473  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.28 
 
 		 336 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 		 342 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 		 336 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.31 
 
 		 344 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.55 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.03 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.08 
 
 		 336 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.64 
 
 		 349 aa  408  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.87 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.99 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.61 
 
 		 354 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  59.94 
 
 		 349 aa  408  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.8 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1324  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.67 
 
 		 355 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.211473  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.52 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.75 
 
 		 336 aa  401  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 		 336 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 		 336 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.76 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 334 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.75 
 
 		 333 aa  401  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.63 
 
 		 345 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.05 
 
 		 541 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 336 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.93 
 
 		 344 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.42 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  58.9 
 
 		 341 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 334 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 334 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.39 
 
 		 341 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 334 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 337 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.65 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 		 346 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 		 346 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.88 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.79 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.4 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.57 
 
 		 347 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.63 
 
 		 340 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.88 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.88 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.64 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.61 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.4 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.7 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.53 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.26 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.72 
 
 		 346 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.84 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.51 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.33 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.41 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.32 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1452  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.84 
 
 		 325 aa  386  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467826  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.06 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0629  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.49 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.151039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 		 348 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.24 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.33 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.45 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>