More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3176 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 345 aa  685    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  82.61 
 
 		 346 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  82.9 
 
 		 346 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  83.19 
 
 		 346 aa  577  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3609  Holliday junction DNA helicase RuvB  80 
 
 		 347 aa  554  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  80.92 
 
 		 346 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  80.92 
 
 		 346 aa  549  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  81.21 
 
 		 346 aa  545  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0149  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.27 
 
 		 369 aa  532  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6906  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.88 
 
 		 348 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1292  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.51 
 
 		 349 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1104  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.61 
 
 		 348 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911797  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0731  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.32 
 
 		 348 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5310  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.56 
 
 		 388 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0751  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.5 
 
 		 351 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3069  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.88 
 
 		 343 aa  511  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672447  normal  0.509611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4768  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.15 
 
 		 356 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.43 
 
 		 348 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5235  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.15 
 
 		 356 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1638  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.93 
 
 		 348 aa  510  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104926 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4803  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.64 
 
 		 349 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0133  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.81 
 
 		 350 aa  507  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526371  normal  0.412568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4436  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.34 
 
 		 344 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3787  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.59 
 
 		 359 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2138  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.68 
 
 		 342 aa  501  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.47 
 
 		 350 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4167  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.57 
 
 		 360 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3521  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.99 
 
 		 347 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2371  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.09 
 
 		 339 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2205  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.27 
 
 		 341 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0553  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.27 
 
 		 341 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1105  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.09 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0530572  normal  0.598113 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.86 
 
 		 341 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.418287  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2724  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.63 
 
 		 348 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1233  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.93 
 
 		 341 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0333  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.3 
 
 		 338 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.693851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.48 
 
 		 352 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0786  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.36 
 
 		 348 aa  471  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0966  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.83 
 
 		 344 aa  474  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.86 
 
 		 342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0559678  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1216  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.57 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.814264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2422  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.88 
 
 		 352 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.48 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2904  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.71 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.56 
 
 		 334 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.47 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.91 
 
 		 337 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.17 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.17 
 
 		 336 aa  428  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.18 
 
 		 352 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.17 
 
 		 334 aa  428  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  62.87 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 		 356 aa  424  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 336 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.94 
 
 		 354 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  62.87 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.87 
 
 		 341 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.31 
 
 		 352 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.39 
 
 		 347 aa  424  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.88 
 
 		 344 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.22 
 
 		 355 aa  424  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.06 
 
 		 355 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.83 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.28 
 
 		 337 aa  425  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 334 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.65 
 
 		 351 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 336 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 336 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.28 
 
 		 336 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.72 
 
 		 357 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 		 356 aa  421  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.57 
 
 		 334 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.41 
 
 		 337 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.34 
 
 		 363 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 336 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.72 
 
 		 337 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 334 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 336 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.74 
 
 		 350 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.4 
 
 		 345 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.44 
 
 		 357 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.44 
 
 		 357 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.57 
 
 		 334 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.69 
 
 		 336 aa  421  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.89 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.36 
 
 		 353 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.82 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.13 
 
 		 341 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.45 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.16 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  63 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>