More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0423 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
342 aa  681    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0559678  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2138  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.42 
 
 
342 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0333  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.33 
 
 
338 aa  513  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.693851  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.62 
 
 
346 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3609  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.26 
 
 
347 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.86 
 
 
345 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.78 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.94 
 
 
346 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.74 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.78 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.94 
 
 
346 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1292  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.67 
 
 
349 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.03 
 
 
348 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2205  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.21 
 
 
341 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0751  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.67 
 
 
351 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0553  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.21 
 
 
341 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0133  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.72 
 
 
350 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526371  normal  0.412568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3069  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.39 
 
 
343 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672447  normal  0.509611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6906  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.73 
 
 
348 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0149  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.78 
 
 
369 aa  457  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1233  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.5 
 
 
341 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2371  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.75 
 
 
339 aa  454  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.68 
 
 
352 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4436  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.48 
 
 
344 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0731  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.65 
 
 
348 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5310  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.17 
 
 
388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0966  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.75 
 
 
344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5235  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.17 
 
 
356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4768  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.17 
 
 
356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1105  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.97 
 
 
357 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0530572  normal  0.598113 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.07 
 
 
350 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.75 
 
 
341 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.418287  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4803  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.15 
 
 
349 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1104  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.45 
 
 
348 aa  448  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911797  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1638  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.85 
 
 
348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4167  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.65 
 
 
360 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165335  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3521  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.62 
 
 
347 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3787  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.4 
 
 
359 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2724  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.82 
 
 
348 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2904  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.18 
 
 
347 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1216  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.96 
 
 
348 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.814264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0786  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.06 
 
 
348 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2422  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.38 
 
 
352 aa  420  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.67 
 
 
347 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.47 
 
 
345 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.75 
 
 
341 aa  413  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.83 
 
 
341 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.54 
 
 
345 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.38 
 
 
356 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.98 
 
 
351 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.54 
 
 
356 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.73 
 
 
354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.5 
 
 
335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.31 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.73 
 
 
352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.29 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.36 
 
 
346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.23 
 
 
355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.09 
 
 
363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.59 
 
 
334 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.86 
 
 
345 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.78 
 
 
334 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.78 
 
 
334 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.68 
 
 
344 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 
337 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.49 
 
 
355 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.94 
 
 
334 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.46 
 
 
334 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.15 
 
 
334 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.94 
 
 
334 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.94 
 
 
334 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.87 
 
 
339 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.4 
 
 
343 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.94 
 
 
334 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.47 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.18 
 
 
357 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.47 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.43 
 
 
343 aa  398  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.11 
 
 
356 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1452  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
325 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467826  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.47 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.8 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.14 
 
 
354 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.21 
 
 
352 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.77 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.02 
 
 
337 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.34 
 
 
350 aa  398  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.47 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.84 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.97 
 
 
344 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.21 
 
 
352 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.47 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.47 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.47 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>