More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3516 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 346 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  99.71 
 
 		 346 aa  684    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  91.33 
 
 		 346 aa  631  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3609  Holliday junction DNA helicase RuvB  91.62 
 
 		 347 aa  629  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  82.61 
 
 		 345 aa  578  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  82.08 
 
 		 346 aa  559  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  82.08 
 
 		 346 aa  559  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  81.79 
 
 		 346 aa  554  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1292  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.36 
 
 		 349 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6906  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.64 
 
 		 348 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0149  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.08 
 
 		 369 aa  518  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.09 
 
 		 348 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1638  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.09 
 
 		 348 aa  519  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4768  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.44 
 
 		 356 aa  511  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5235  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.44 
 
 		 356 aa  511  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4803  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.91 
 
 		 349 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5310  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.15 
 
 		 388 aa  511  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0133  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.29 
 
 		 350 aa  504  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526371  normal  0.412568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1104  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.91 
 
 		 348 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911797  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0751  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.93 
 
 		 351 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0731  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.62 
 
 		 348 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4167  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.51 
 
 		 360 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3069  Holliday junction DNA helicase RuvB  75 
 
 		 343 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672447  normal  0.509611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3521  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.18 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4436  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.53 
 
 		 344 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2138  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.76 
 
 		 342 aa  484  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3787  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.92 
 
 		 359 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.99 
 
 		 341 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.418287  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1105  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.64 
 
 		 357 aa  475  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0530572  normal  0.598113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2724  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.54 
 
 		 348 aa  477  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0553  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.69 
 
 		 341 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.14 
 
 		 352 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2205  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.69 
 
 		 341 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2371  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.62 
 
 		 339 aa  474  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.71 
 
 		 350 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1233  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.62 
 
 		 341 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.78 
 
 		 342 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0559678  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0966  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.64 
 
 		 344 aa  465  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0333  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.57 
 
 		 338 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.693851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0786  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.74 
 
 		 348 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1216  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.09 
 
 		 348 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.814264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.67 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.07 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.37 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.37 
 
 		 334 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.37 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.26 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.47 
 
 		 334 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2904  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.79 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2422  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.17 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.17 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.47 
 
 		 334 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.24 
 
 		 351 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.17 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.58 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.99 
 
 		 352 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.25 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.13 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.25 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.66 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.83 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.01 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.83 
 
 		 338 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.28 
 
 		 345 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.35 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.46 
 
 		 337 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.76 
 
 		 355 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.83 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.05 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.9 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.96 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.15 
 
 		 357 aa  411  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.38 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.78 
 
 		 356 aa  411  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 		 341 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.52 
 
 		 341 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.83 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.31 
 
 		 347 aa  411  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.65 
 
 		 355 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.31 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.27 
 
 		 354 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.68 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1452  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.6 
 
 		 325 aa  414  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467826  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.6 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.38 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.21 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.38 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.38 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.54 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.42 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.38 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.47 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.38 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.26 
 
 		 344 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.96 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>