More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2904 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2904  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 347 aa  674    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1216  Holliday junction DNA helicase RuvB  79.76 
 
 		 348 aa  501  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.814264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.89 
 
 		 350 aa  481  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6906  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.96 
 
 		 348 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2138  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.01 
 
 		 342 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.96 
 
 		 348 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1292  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.55 
 
 		 349 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0333  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.87 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.693851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3069  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.3 
 
 		 343 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672447  normal  0.509611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4803  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.72 
 
 		 349 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.71 
 
 		 345 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.34 
 
 		 346 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.16 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.16 
 
 		 346 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.16 
 
 		 346 aa  444  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.86 
 
 		 352 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.79 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.79 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3609  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.38 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.18 
 
 		 342 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0559678  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0133  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.35 
 
 		 350 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526371  normal  0.412568 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2205  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.85 
 
 		 341 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0149  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.97 
 
 		 369 aa  437  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0553  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.85 
 
 		 341 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4167  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.23 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3521  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.06 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1638  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.2 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1233  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.16 
 
 		 341 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1105  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.07 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0530572  normal  0.598113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0786  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.27 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5235  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.78 
 
 		 356 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2724  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.7 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0966  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.65 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5310  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.47 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2371  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.22 
 
 		 339 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1104  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.08 
 
 		 348 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911797  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4768  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.78 
 
 		 356 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0751  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.27 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.19 
 
 		 341 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.418287  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.5 
 
 		 345 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0731  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.37 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3787  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.67 
 
 		 359 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4436  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.49 
 
 		 344 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.92 
 
 		 346 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2422  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.02 
 
 		 352 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 		 348 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.15 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.56 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.15 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 		 348 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.38 
 
 		 341 aa  408  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.78 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 		 348 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.93 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.4 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.01 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.45 
 
 		 350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.98 
 
 		 343 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.28 
 
 		 343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.99 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.53 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.58 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.82 
 
 		 357 aa  401  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.92 
 
 		 353 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.56 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.87 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.79 
 
 		 352 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.84 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.89 
 
 		 345 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.59 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.26 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.82 
 
 		 344 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.55 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.86 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.59 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.43 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.25 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.23 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.03 
 
 		 353 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.64 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.83 
 
 		 363 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0063  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.389593  normal  0.914826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.06 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.59 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.59 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 		 336 aa  391  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.98 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.64 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0062  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.64 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>