More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2117 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 352 aa  687    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.29 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6906  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.04 
 
 		 348 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.57 
 
 		 346 aa  481  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.57 
 
 		 346 aa  481  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0133  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.13 
 
 		 350 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526371  normal  0.412568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4803  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.67 
 
 		 349 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.87 
 
 		 346 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3609  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.57 
 
 		 347 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1292  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.88 
 
 		 349 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.27 
 
 		 346 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.48 
 
 		 345 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0149  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.04 
 
 		 369 aa  479  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0731  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.35 
 
 		 348 aa  478  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3069  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.42 
 
 		 343 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672447  normal  0.509611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.14 
 
 		 346 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4768  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.09 
 
 		 356 aa  474  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.14 
 
 		 346 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1638  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.18 
 
 		 348 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5235  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.09 
 
 		 356 aa  474  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4167  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.07 
 
 		 360 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3521  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.86 
 
 		 347 aa  472  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1104  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.24 
 
 		 348 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911797  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5310  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.21 
 
 		 388 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2724  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.04 
 
 		 348 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.3 
 
 		 350 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3787  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.69 
 
 		 359 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0751  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.62 
 
 		 351 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0333  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.96 
 
 		 338 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.693851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1233  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.76 
 
 		 341 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4436  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.78 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.68 
 
 		 342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0559678  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1105  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.73 
 
 		 357 aa  448  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0530572  normal  0.598113 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0553  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.56 
 
 		 341 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2205  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.56 
 
 		 341 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2371  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.07 
 
 		 339 aa  448  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2138  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.93 
 
 		 342 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.47 
 
 		 341 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.418287  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0966  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.75 
 
 		 344 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2422  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.85 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0786  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.07 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1216  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.02 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.814264 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2904  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.86 
 
 		 347 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215191  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 		 345 aa  418  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.75 
 
 		 358 aa  418  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.24 
 
 		 354 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.75 
 
 		 341 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.84 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.47 
 
 		 345 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 		 334 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 		 334 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.88 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.75 
 
 		 356 aa  411  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  60.98 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.73 
 
 		 351 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 		 353 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.91 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 		 334 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.61 
 
 		 344 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.65 
 
 		 343 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.78 
 
 		 363 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.45 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.35 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.23 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.59 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 334 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.39 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.42 
 
 		 354 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.6 
 
 		 355 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 		 346 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.45 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.2 
 
 		 334 aa  408  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.64 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.64 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.67 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.24 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.86 
 
 		 336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.96 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.84 
 
 		 355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.86 
 
 		 334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.6 
 
 		 352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.96 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.86 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.52 
 
 		 345 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.45 
 
 		 352 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 		 351 aa  401  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.59 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.9 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 		 351 aa  401  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.77 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.4 
 
 		 348 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>