More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0473 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 343 aa  687    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.71 
 
 		 341 aa  448  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.36 
 
 		 347 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  65.45 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.45 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.88 
 
 		 338 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.03 
 
 		 334 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  65.45 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.45 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.45 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.45 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.45 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.27 
 
 		 357 aa  434  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.45 
 
 		 336 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.85 
 
 		 336 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.96 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.38 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.71 
 
 		 338 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.45 
 
 		 336 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.15 
 
 		 336 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.08 
 
 		 345 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.16 
 
 		 354 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.96 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.85 
 
 		 336 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.85 
 
 		 336 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.26 
 
 		 337 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.85 
 
 		 336 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.96 
 
 		 337 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.83 
 
 		 341 aa  431  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.02 
 
 		 334 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.86 
 
 		 355 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.37 
 
 		 355 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.85 
 
 		 336 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.36 
 
 		 351 aa  431  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.33 
 
 		 336 aa  431  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 		 338 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.46 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.02 
 
 		 334 aa  428  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.15 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.46 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.56 
 
 		 363 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.46 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.65 
 
 		 361 aa  428  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.09 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.41 
 
 		 336 aa  428  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.72 
 
 		 334 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.37 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.2 
 
 		 354 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.46 
 
 		 334 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.45 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.02 
 
 		 334 aa  428  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.75 
 
 		 350 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3069  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.67 
 
 		 343 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672447  normal  0.509611 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.02 
 
 		 334 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.55 
 
 		 334 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.24 
 
 		 358 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.42 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.41 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.09 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.36 
 
 		 343 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.15 
 
 		 346 aa  425  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.94 
 
 		 334 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.94 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.42 
 
 		 354 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.11 
 
 		 340 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.24 
 
 		 358 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 		 350 aa  421  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.55 
 
 		 352 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.24 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.24 
 
 		 363 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.77 
 
 		 339 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.94 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.01 
 
 		 335 aa  418  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.73 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.26 
 
 		 354 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.05 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0063  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.35 
 
 		 340 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.389593  normal  0.914826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0062  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.35 
 
 		 340 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.53 
 
 		 354 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.92 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  64 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.54 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.35 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.87 
 
 		 348 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.86 
 
 		 356 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.92 
 
 		 337 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.01 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.94 
 
 		 346 aa  414  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.95 
 
 		 356 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.01 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.24 
 
 		 352 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.95 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.46 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.95 
 
 		 356 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.95 
 
 		 356 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.95 
 
 		 356 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.01 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.94 
 
 		 334 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>