More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1116 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 338 aa  678    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.49 
 
 		 338 aa  455  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.9 
 
 		 330 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.05 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.96 
 
 		 336 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.85 
 
 		 336 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.85 
 
 		 336 aa  433  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.73 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.23 
 
 		 344 aa  431  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.61 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.73 
 
 		 346 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.61 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 336 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 336 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 336 aa  425  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.37 
 
 		 342 aa  425  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.69 
 
 		 344 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.8 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.15 
 
 		 541 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.56 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.3 
 
 		 336 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.76 
 
 		 337 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.06 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.23 
 
 		 333 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 333 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.62 
 
 		 363 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 333 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 333 aa  421  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.46 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.33 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.38 
 
 		 336 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.51 
 
 		 345 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.46 
 
 		 339 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.51 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  61.85 
 
 		 341 aa  415  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.32 
 
 		 358 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 333 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.03 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.34 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.94 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.49 
 
 		 343 aa  414  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.08 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.03 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.15 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 356 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.51 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.03 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.51 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.34 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.34 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 		 354 aa  411  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.78 
 
 		 345 aa  411  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.39 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.31 
 
 		 341 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.23 
 
 		 346 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.24 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 350 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 354 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.34 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.51 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.08 
 
 		 356 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.39 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.83 
 
 		 334 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.2 
 
 		 334 aa  411  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.92 
 
 		 332 aa  408  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 		 334 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 		 344 aa  408  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.81 
 
 		 341 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1452  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 		 325 aa  410  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467826  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.13 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 		 344 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 354 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.42 
 
 		 355 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.15 
 
 		 336 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.57 
 
 		 334 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  61.29 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 346 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 		 334 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.92 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.92 
 
 		 336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>