More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12840 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  100 
 
 
342 aa  690    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  83.08 
 
 
346 aa  558  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  82.09 
 
 
351 aa  554  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.96 
 
 
355 aa  477  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 
336 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  64 
 
 
344 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 
342 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.38 
 
 
349 aa  418  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.61 
 
 
333 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.77 
 
 
336 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  61.98 
 
 
349 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.54 
 
 
338 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.92 
 
 
344 aa  420  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.49 
 
 
349 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 
346 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.57 
 
 
338 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.18 
 
 
334 aa  411  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 
337 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
346 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.51 
 
 
339 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.79 
 
 
541 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.92 
 
 
330 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 
335 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.27 
 
 
338 aa  408  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 
333 aa  408  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.28 
 
 
337 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 
336 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 
336 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 
336 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 
333 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 
333 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
337 aa  408  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.45 
 
 
338 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 
333 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
336 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.29 
 
 
338 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 
333 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.45 
 
 
338 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  59.28 
 
 
355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.38 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.04 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.09 
 
 
333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.31 
 
 
333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 
333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.04 
 
 
354 aa  404  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.27 
 
 
347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.4 
 
 
350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.62 
 
 
334 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.76 
 
 
337 aa  401  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.32 
 
 
338 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.62 
 
 
334 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.57 
 
 
345 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.62 
 
 
334 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.62 
 
 
334 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.82 
 
 
332 aa  398  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
338 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 
340 aa  398  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.93 
 
 
354 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.13 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.18 
 
 
337 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.82 
 
 
335 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 
335 aa  401  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.71 
 
 
334 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.71 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.59 
 
 
340 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 
344 aa  398  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.71 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.27 
 
 
338 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 
354 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.56 
 
 
346 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 
357 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.18 
 
 
351 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 
357 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.4 
 
 
334 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 
348 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.71 
 
 
352 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1215  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 
351 aa  396  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.423128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.43 
 
 
347 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.86 
 
 
356 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 
357 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.32 
 
 
337 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.53 
 
 
355 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 
346 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.55 
 
 
356 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 
347 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.93 
 
 
337 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.94 
 
 
337 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 
336 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 
358 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 
356 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.72 
 
 
344 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.28 
 
 
336 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 
355 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.57 
 
 
354 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.4 
 
 
334 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  58.28 
 
 
336 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.28 
 
 
336 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.28 
 
 
336 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>