More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2295 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
354 aa  709    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.45 
 
 
347 aa  511  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.28 
 
 
347 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.61 
 
 
350 aa  512  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.72 
 
 
335 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  63.29 
 
 
349 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.15 
 
 
349 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.53 
 
 
330 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.66 
 
 
338 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.1 
 
 
342 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.16 
 
 
349 aa  433  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 
336 aa  428  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.93 
 
 
344 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.69 
 
 
339 aa  428  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
336 aa  421  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.24 
 
 
336 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 
338 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.88 
 
 
336 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.03 
 
 
338 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.12 
 
 
541 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 
333 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
336 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
336 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
333 aa  418  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.91 
 
 
333 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 
333 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.22 
 
 
337 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
333 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 
346 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
333 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  61.77 
 
 
341 aa  414  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.68 
 
 
338 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.61 
 
 
333 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.6 
 
 
351 aa  417  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 
346 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 
338 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.63 
 
 
338 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 
347 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 
335 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.31 
 
 
337 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 
344 aa  411  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.08 
 
 
335 aa  413  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
333 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
345 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.28 
 
 
343 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.96 
 
 
353 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 
341 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.61 
 
 
355 aa  411  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0928  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.63 
 
 
354 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.64 
 
 
350 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 
334 aa  411  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 
337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  60 
 
 
346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 
337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 
352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.42 
 
 
356 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.75 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.45 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.42 
 
 
356 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.42 
 
 
356 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.42 
 
 
356 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.53 
 
 
356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.54 
 
 
351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 
356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.42 
 
 
356 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.61 
 
 
333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.56 
 
 
344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.04 
 
 
345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.42 
 
 
356 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.42 
 
 
356 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 
356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  59.04 
 
 
342 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 
356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.1 
 
 
345 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 
352 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.78 
 
 
341 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.98 
 
 
354 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 
356 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.1 
 
 
357 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
338 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.98 
 
 
355 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.61 
 
 
350 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.76 
 
 
354 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.1 
 
 
357 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  59.52 
 
 
355 aa  401  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.34 
 
 
334 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.18 
 
 
354 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.18 
 
 
355 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.33 
 
 
363 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.95 
 
 
344 aa  401  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.41 
 
 
355 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
334 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.34 
 
 
334 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.43 
 
 
358 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 
354 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.27 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>