More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0606 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
349 aa  709    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  94.84 
 
 
349 aa  676    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  96.28 
 
 
349 aa  684    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.6 
 
 
347 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.22 
 
 
347 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.71 
 
 
342 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.58 
 
 
336 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.65 
 
 
350 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.19 
 
 
344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.36 
 
 
336 aa  440  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  63.72 
 
 
341 aa  434  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.53 
 
 
338 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.11 
 
 
338 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.74 
 
 
333 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.37 
 
 
336 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.37 
 
 
336 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.37 
 
 
336 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.74 
 
 
333 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.74 
 
 
333 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.13 
 
 
330 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.16 
 
 
354 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.74 
 
 
541 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.12 
 
 
338 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.33 
 
 
338 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.63 
 
 
338 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.74 
 
 
333 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.05 
 
 
333 aa  428  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.92 
 
 
338 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.44 
 
 
333 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.76 
 
 
333 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.63 
 
 
337 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.02 
 
 
335 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.02 
 
 
337 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.13 
 
 
333 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.54 
 
 
344 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.94 
 
 
333 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  61.38 
 
 
342 aa  418  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.61 
 
 
348 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.35 
 
 
336 aa  415  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.04 
 
 
336 aa  415  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.68 
 
 
341 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.67 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  62.46 
 
 
346 aa  416  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 
344 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0928  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.92 
 
 
354 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.64 
 
 
355 aa  408  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.68 
 
 
351 aa  408  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.59 
 
 
345 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.33 
 
 
351 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.7 
 
 
341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.45 
 
 
334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.24 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.84 
 
 
351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.84 
 
 
351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 
335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.04 
 
 
339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 
343 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.48 
 
 
345 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.43 
 
 
357 aa  401  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 
337 aa  401  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.41 
 
 
356 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.41 
 
 
356 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.41 
 
 
356 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.41 
 
 
356 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.41 
 
 
356 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.61 
 
 
340 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.26 
 
 
347 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.41 
 
 
356 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.93 
 
 
344 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.26 
 
 
350 aa  401  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.8 
 
 
346 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.41 
 
 
356 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.82 
 
 
355 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.06 
 
 
347 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 
337 aa  401  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.81 
 
 
354 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.41 
 
 
355 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 
334 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.09 
 
 
352 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.06 
 
 
356 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.86 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.12 
 
 
356 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.42 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.65 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.12 
 
 
354 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.84 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.18 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 
346 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.94 
 
 
332 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.11 
 
 
354 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.28 
 
 
343 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.28 
 
 
343 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.21 
 
 
336 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.31 
 
 
336 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.77 
 
 
346 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.31 
 
 
336 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>