More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0928 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0928  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
354 aa  712    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 
342 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.33 
 
 
338 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.92 
 
 
349 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 
349 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.35 
 
 
336 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  60.92 
 
 
349 aa  411  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.11 
 
 
330 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.63 
 
 
354 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.91 
 
 
348 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.75 
 
 
333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.71 
 
 
347 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.24 
 
 
541 aa  401  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.08 
 
 
350 aa  401  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.81 
 
 
333 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.42 
 
 
347 aa  403  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
344 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.14 
 
 
333 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 
333 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.19 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.05 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.04 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.46 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.86 
 
 
338 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
333 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 
338 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
333 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  63 
 
 
344 aa  395  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.04 
 
 
338 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.66 
 
 
333 aa  391  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.67 
 
 
336 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.56 
 
 
337 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.45 
 
 
339 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 
345 aa  388  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  56.23 
 
 
341 aa  388  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 
353 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 
334 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.58 
 
 
341 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 
338 aa  388  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 
351 aa  385  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.16 
 
 
346 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.51 
 
 
338 aa  387  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 
334 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.95 
 
 
345 aa  381  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
338 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 
334 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  58.46 
 
 
346 aa  382  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 
334 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 
334 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 
334 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1324  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.02 
 
 
355 aa  381  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.211473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 
346 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.75 
 
 
334 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.75 
 
 
334 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.32 
 
 
348 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.79 
 
 
336 aa  378  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.45 
 
 
334 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.81 
 
 
347 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.32 
 
 
348 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 
338 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 
336 aa  378  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.62 
 
 
348 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.68 
 
 
344 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.69 
 
 
334 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
337 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.53 
 
 
337 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.75 
 
 
334 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 
351 aa  381  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 
336 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.45 
 
 
334 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  56.17 
 
 
336 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 
336 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 
336 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.68 
 
 
337 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.43 
 
 
336 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.43 
 
 
336 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.08 
 
 
334 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1745  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.86 
 
 
322 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.430959  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 
336 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.43 
 
 
336 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 
336 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.13 
 
 
334 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 
335 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  56.17 
 
 
336 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 
336 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 
336 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.38 
 
 
336 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.13 
 
 
334 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.43 
 
 
336 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.57 
 
 
343 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 
336 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.43 
 
 
336 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.15 
 
 
344 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4544  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.42 
 
 
360 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.076063  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.19 
 
 
363 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>