More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1745 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1745  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 322 aa  651    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.430959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1267  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.16 
 
 		 327 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.330108  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3205  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.27 
 
 		 334 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.12 
 
 		 321 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0989  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.12 
 
 		 320 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3493  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.83 
 
 		 324 aa  471  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.19 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.46 
 
 		 352 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.87 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.95 
 
 		 355 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 		 363 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.95 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.26 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.5 
 
 		 355 aa  407  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.15 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.59 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.1 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.4 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.7 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.64 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.35 
 
 		 336 aa  401  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.97 
 
 		 358 aa  401  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.17 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.7 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.94 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.32 
 
 		 356 aa  401  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.46 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.94 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.29 
 
 		 342 aa  401  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.22 
 
 		 345 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.42 
 
 		 334 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.03 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.94 
 
 		 353 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.38 
 
 		 350 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 		 334 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 		 334 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.5 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.26 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.42 
 
 		 334 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.81 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 		 334 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  59.81 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.81 
 
 		 346 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.51 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 345 aa  394  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.97 
 
 		 356 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  59.81 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.98 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.42 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.47 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 		 334 aa  394  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.5 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.42 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.29 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 355 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.81 
 
 		 346 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.94 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.86 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.73 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.73 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.47 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.97 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 346 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>