More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15320 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_15320  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  100 
 
 
357 aa  700    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.280238  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.43 
 
 
355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2031  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.33 
 
 
361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000121008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2301  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.96 
 
 
362 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.24 
 
 
337 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17530  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  67.25 
 
 
355 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.200391 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.95 
 
 
352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.68 
 
 
360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.5 
 
 
367 aa  443  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1668  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.94 
 
 
367 aa  443  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.06 
 
 
351 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12880  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.25 
 
 
340 aa  438  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.579747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.87 
 
 
349 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.01 
 
 
382 aa  434  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2111  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.37 
 
 
353 aa  434  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00345242  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.67 
 
 
348 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13960  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  68.64 
 
 
353 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577435  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1796  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.66 
 
 
359 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.116666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.77 
 
 
353 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  68.47 
 
 
374 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1994  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.34 
 
 
345 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6111  Holliday junction DNA helicase B  66.36 
 
 
352 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0830946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2306  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.29 
 
 
357 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3824  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.79 
 
 
357 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.265234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.87 
 
 
368 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2267  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.29 
 
 
357 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2314  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.29 
 
 
357 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.83 
 
 
370 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1800  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.4 
 
 
354 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383421  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2575  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.79 
 
 
355 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.24 
 
 
353 aa  420  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.01 
 
 
366 aa  418  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1810  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.14 
 
 
354 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794577  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12612  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.07 
 
 
344 aa  418  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553587  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1936  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.56 
 
 
364 aa  414  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2302  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.76 
 
 
363 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3826  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.17 
 
 
359 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0702287  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0453  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.83 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00906919  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  57.58 
 
 
346 aa  384  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.04 
 
 
338 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.82 
 
 
342 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 
347 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 
344 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 
351 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.53 
 
 
349 aa  370  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  54.19 
 
 
342 aa  371  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.1 
 
 
347 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.8 
 
 
337 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 
346 aa  368  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.48 
 
 
335 aa  371  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  54.22 
 
 
349 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.43 
 
 
338 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.91 
 
 
355 aa  366  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.45 
 
 
336 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.15 
 
 
336 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.25 
 
 
338 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  54.91 
 
 
355 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.74 
 
 
349 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.86 
 
 
363 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 
346 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 
347 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 
351 aa  364  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.83 
 
 
334 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.45 
 
 
338 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.4 
 
 
354 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.21 
 
 
334 aa  363  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 
339 aa  363  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.03 
 
 
337 aa  362  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.73 
 
 
337 aa  361  9e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.94 
 
 
338 aa  361  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.24 
 
 
355 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.52 
 
 
345 aa  361  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.69 
 
 
356 aa  361  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.78 
 
 
345 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.79 
 
 
356 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.78 
 
 
351 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.87 
 
 
338 aa  359  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.92 
 
 
355 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 
340 aa  359  4e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.78 
 
 
337 aa  358  5e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.44 
 
 
345 aa  359  5e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 
346 aa  359  5e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
335 aa  358  6e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.94 
 
 
352 aa  358  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.32 
 
 
344 aa  358  9e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.07 
 
 
334 aa  358  9e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.08 
 
 
353 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 
340 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.29 
 
 
343 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.61 
 
 
354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.47 
 
 
356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.29 
 
 
343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.31 
 
 
337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 
336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.21 
 
 
336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.78 
 
 
335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.71 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.71 
 
 
334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.89 
 
 
358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.63 
 
 
356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>