More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17530  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  100 
 
 		 355 aa  682    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.200391 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  85.04 
 
 		 352 aa  566  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1796  Holliday junction DNA helicase RuvB  84.87 
 
 		 359 aa  531  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.116666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1668  Holliday junction DNA helicase RuvB  81.44 
 
 		 367 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.95 
 
 		 355 aa  507  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1994  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.89 
 
 		 345 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.32 
 
 		 351 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2031  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.92 
 
 		 361 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000121008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.77 
 
 		 382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2301  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.29 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171399  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2111  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.84 
 
 		 353 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00345242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13960  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  76.28 
 
 		 353 aa  465  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.53 
 
 		 337 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.78 
 
 		 360 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.64 
 
 		 367 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.96 
 
 		 348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6111  Holliday junction DNA helicase B  71.34 
 
 		 352 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0830946 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12880  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.33 
 
 		 340 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.579747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.64 
 
 		 349 aa  448  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.24 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2306  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.38 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3824  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.06 
 
 		 357 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.265234 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2302  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.7 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2267  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.38 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2314  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.38 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1810  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.88 
 
 		 354 aa  441  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  70.31 
 
 		 374 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1800  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.88 
 
 		 354 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383421  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.76 
 
 		 353 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2575  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.62 
 
 		 355 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12612  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.34 
 
 		 344 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.07 
 
 		 368 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1936  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.18 
 
 		 364 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15320  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  67.25 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.280238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.97 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3826  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.37 
 
 		 359 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0702287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0453  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.43 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00906919  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1215  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.71 
 
 		 351 aa  387  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.423128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.83 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3181  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.62 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.05 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.82 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.4 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.97 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.89 
 
 		 338 aa  371  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.05 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.1 
 
 		 337 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.6 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.27 
 
 		 342 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.45 
 
 		 346 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.13 
 
 		 339 aa  368  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.12 
 
 		 345 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.95 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.52 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.35 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.15 
 
 		 346 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.14 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.41 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  57.51 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.17 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.22 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.45 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.89 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.65 
 
 		 355 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.57 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.09 
 
 		 356 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 		 336 aa  362  6e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.16 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.75 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.06 
 
 		 358 aa  361  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.59 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.76 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.76 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.79 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 356 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 356 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 356 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 356 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 356 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 356 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.94 
 
 		 334 aa  359  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.94 
 
 		 334 aa  359  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 356 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 356 aa  359  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 		 347 aa  359  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.99 
 
 		 357 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.99 
 
 		 357 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.13 
 
 		 343 aa  359  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.85 
 
 		 357 aa  358  6e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.94 
 
 		 334 aa  358  6e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.1 
 
 		 344 aa  358  6e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>