More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2354 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 337 aa  657    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6111  Holliday junction DNA helicase B  76.18 
 
 		 352 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0830946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2111  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.93 
 
 		 353 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00345242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.08 
 
 		 367 aa  486  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.78 
 
 		 360 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  73 
 
 		 352 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.61 
 
 		 349 aa  478  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1936  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.94 
 
 		 364 aa  471  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1668  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.38 
 
 		 367 aa  472  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.62 
 
 		 351 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2031  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.59 
 
 		 361 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000121008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17530  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  74.53 
 
 		 355 aa  466  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.200391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2301  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.21 
 
 		 362 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171399  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.99 
 
 		 355 aa  465  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.64 
 
 		 353 aa  461  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2306  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.88 
 
 		 357 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3824  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.58 
 
 		 357 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.265234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2267  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.88 
 
 		 357 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.01 
 
 		 382 aa  461  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2302  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.97 
 
 		 363 aa  461  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2314  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.88 
 
 		 357 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12880  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.12 
 
 		 340 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.579747  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2575  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.15 
 
 		 355 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.64 
 
 		 368 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12612  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.36 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.48 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  70.94 
 
 		 374 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1796  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.49 
 
 		 359 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.116666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.79 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1994  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.73 
 
 		 345 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1810  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.34 
 
 		 354 aa  450  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1800  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.75 
 
 		 354 aa  447  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383421  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3826  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.5 
 
 		 359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0702287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.28 
 
 		 366 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15320  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  69.94 
 
 		 357 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.280238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.58 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13960  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  73.58 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577435  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0453  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.35 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00906919  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.13 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.93 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.93 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.99 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.93 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.43 
 
 		 351 aa  388  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.96 
 
 		 334 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  55.39 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.39 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.69 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.76 
 
 		 335 aa  384  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.39 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.39 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.99 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.98 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.39 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  55.39 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.39 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.89 
 
 		 334 aa  384  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.39 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.99 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.72 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.31 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.72 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.72 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.44 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.93 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  56.33 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.6 
 
 		 330 aa  378  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.44 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.01 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.68 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.68 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.68 
 
 		 351 aa  381  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.32 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.68 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.92 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.93 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.82 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.64 
 
 		 338 aa  374  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.86 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 		 343 aa  374  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.69 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 339 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>