More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0839 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
382 aa  748    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  85.29 
 
 
351 aa  568  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2111  Holliday junction DNA helicase RuvB  80.97 
 
 
353 aa  522  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00345242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6111  Holliday junction DNA helicase B  77.29 
 
 
352 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0830946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.9 
 
 
349 aa  508  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.13 
 
 
360 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.55 
 
 
355 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17530  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  74.62 
 
 
355 aa  478  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.200391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3824  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.34 
 
 
357 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.265234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.86 
 
 
367 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2267  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.99 
 
 
357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.45 
 
 
368 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2306  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.99 
 
 
357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2302  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.54 
 
 
363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2314  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.99 
 
 
357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2575  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.04 
 
 
355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12612  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.56 
 
 
344 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553587  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.65 
 
 
353 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.88 
 
 
337 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  71.04 
 
 
374 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.21 
 
 
370 aa  460  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.26 
 
 
352 aa  458  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1800  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.25 
 
 
354 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383421  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1796  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.85 
 
 
359 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.116666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2031  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.53 
 
 
361 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000121008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1936  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.75 
 
 
364 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2301  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.21 
 
 
362 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171399  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1668  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.85 
 
 
367 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.59 
 
 
366 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1810  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.35 
 
 
354 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794577  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.21 
 
 
348 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1994  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.08 
 
 
345 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12880  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.98 
 
 
340 aa  444  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.579747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3826  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.14 
 
 
359 aa  438  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0702287  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13960  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  72.7 
 
 
353 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577435  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15320  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  67.07 
 
 
357 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.280238  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.99 
 
 
353 aa  401  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 
356 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 
356 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.7 
 
 
354 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.91 
 
 
358 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 
354 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 
338 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.16 
 
 
356 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.63 
 
 
345 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0453  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.25 
 
 
348 aa  381  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00906919  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.16 
 
 
354 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.28 
 
 
347 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 
357 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 
352 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.49 
 
 
341 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 
363 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.06 
 
 
357 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.77 
 
 
344 aa  375  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.67 
 
 
363 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.06 
 
 
357 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 
354 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 
356 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 
356 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.76 
 
 
361 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 
356 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.99 
 
 
541 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.64 
 
 
356 aa  371  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 
336 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 
356 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.82 
 
 
351 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.69 
 
 
355 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 
356 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.13 
 
 
342 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 
356 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.31 
 
 
356 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.41 
 
 
338 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.25 
 
 
339 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 
356 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  55.25 
 
 
346 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 
335 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 
333 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.06 
 
 
355 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 
333 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.72 
 
 
338 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 
336 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 
336 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 
336 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 
338 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 
356 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.98 
 
 
354 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.18 
 
 
344 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.15 
 
 
355 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.56 
 
 
336 aa  368  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 
333 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.37 
 
 
346 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.37 
 
 
346 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 
333 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
333 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 
333 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.35 
 
 
358 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 
340 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.45 
 
 
355 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 
333 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 
336 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>