More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2063 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 349 aa  676    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6111  Holliday junction DNA helicase B  84.2 
 
 		 352 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0830946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2111  Holliday junction DNA helicase RuvB  81.07 
 
 		 353 aa  527  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00345242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.68 
 
 		 351 aa  518  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.74 
 
 		 382 aa  498  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.93 
 
 		 367 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2306  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.71 
 
 		 357 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2267  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.71 
 
 		 357 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.38 
 
 		 360 aa  484  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2314  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.71 
 
 		 357 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3824  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.53 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.265234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12612  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.13 
 
 		 344 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.61 
 
 		 337 aa  478  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2575  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.97 
 
 		 355 aa  478  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.29 
 
 		 353 aa  474  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.19 
 
 		 368 aa  474  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  74.55 
 
 		 374 aa  471  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2302  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.35 
 
 		 363 aa  471  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1936  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.92 
 
 		 364 aa  468  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1800  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.3 
 
 		 354 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383421  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.03 
 
 		 370 aa  465  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1810  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.12 
 
 		 354 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2301  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.6 
 
 		 362 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171399  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2031  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.91 
 
 		 361 aa  458  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000121008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1994  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.4 
 
 		 345 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.29 
 
 		 366 aa  458  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.47 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.61 
 
 		 352 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.01 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3826  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.47 
 
 		 359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0702287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17530  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  72.64 
 
 		 355 aa  448  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.200391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1668  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.08 
 
 		 367 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12880  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.41 
 
 		 340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.579747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1796  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.22 
 
 		 359 aa  438  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.116666 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15320  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  66.87 
 
 		 357 aa  430  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.280238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13960  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  68.33 
 
 		 353 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577435  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0453  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.47 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00906919  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.16 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.46 
 
 		 334 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 		 342 aa  391  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.47 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.48 
 
 		 357 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.84 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.9 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.39 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.39 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.46 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.15 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.16 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.38 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.84 
 
 		 352 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.32 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.96 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.72 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.38 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.56 
 
 		 347 aa  378  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.8 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.6 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.53 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.44 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.38 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.57 
 
 		 358 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.44 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  56 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.44 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.1 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.76 
 
 		 345 aa  374  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.49 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.44 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.67 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.44 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.44 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.44 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.6 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.85 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.31 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.66 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.92 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.6 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>