More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1343 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 367 aa  712    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2111  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.11 
 
 		 353 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00345242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.33 
 
 		 351 aa  500  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.93 
 
 		 349 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.06 
 
 		 360 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6111  Holliday junction DNA helicase B  71.55 
 
 		 352 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0830946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.08 
 
 		 337 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2267  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.93 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.49 
 
 		 353 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2306  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.93 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2314  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.93 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3824  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.95 
 
 		 357 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.265234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.89 
 
 		 348 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1810  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.84 
 
 		 354 aa  474  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  72.87 
 
 		 374 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1800  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.21 
 
 		 354 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383421  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2575  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.14 
 
 		 355 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12612  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.41 
 
 		 344 aa  472  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1936  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.3 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.89 
 
 		 352 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.94 
 
 		 355 aa  467  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2302  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.05 
 
 		 363 aa  461  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17530  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  72.64 
 
 		 355 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.200391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3826  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.56 
 
 		 359 aa  461  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0702287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.91 
 
 		 382 aa  464  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.4 
 
 		 370 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.39 
 
 		 368 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2031  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.12 
 
 		 361 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000121008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2301  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 		 362 aa  461  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171399  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1668  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.89 
 
 		 367 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.81 
 
 		 366 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1796  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.39 
 
 		 359 aa  448  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.116666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1994  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.87 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12880  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.81 
 
 		 340 aa  441  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.579747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15320  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  68.5 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.280238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13960  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  67.61 
 
 		 353 aa  428  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577435  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.01 
 
 		 353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 		 344 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0453  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00906919  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.08 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 342 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.96 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.9 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.33 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.51 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.07 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.26 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.51 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  56 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.69 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.14 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.64 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.75 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.68 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 340 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.73 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.37 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.92 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.33 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.32 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  56.27 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.84 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.84 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.52 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.84 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>