More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1800 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1800  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 354 aa  686    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383421  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1810  Holliday junction DNA helicase RuvB  95.76 
 
 		 354 aa  658    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3826  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.05 
 
 		 359 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0702287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.55 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2267  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.25 
 
 		 357 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2306  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.25 
 
 		 357 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2314  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.25 
 
 		 357 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.55 
 
 		 368 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2111  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.92 
 
 		 353 aa  483  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00345242  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3824  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.72 
 
 		 357 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.265234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6111  Holliday junction DNA helicase B  72.75 
 
 		 352 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0830946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.21 
 
 		 367 aa  477  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12612  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.02 
 
 		 344 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.51 
 
 		 353 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2575  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.81 
 
 		 355 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1936  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.47 
 
 		 364 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.3 
 
 		 349 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.81 
 
 		 348 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  71.56 
 
 		 374 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2302  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.89 
 
 		 363 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.44 
 
 		 351 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.25 
 
 		 370 aa  460  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.57 
 
 		 382 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.75 
 
 		 337 aa  447  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.77 
 
 		 352 aa  443  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17530  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  69.88 
 
 		 355 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.200391 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.14 
 
 		 360 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1668  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.65 
 
 		 367 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.98 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1796  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.25 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.116666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1994  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.15 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2301  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.71 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171399  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2031  Holliday junction DNA helicase RuvB  62 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000121008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15320  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  66.56 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.280238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12880  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.55 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.579747  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13960  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  67.59 
 
 		 353 aa  393  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.23 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 344 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.28 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.69 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.69 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.43 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.89 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.71 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.14 
 
 		 337 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.32 
 
 		 358 aa  381  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.25 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.7 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.85 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.85 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.24 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.85 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.19 
 
 		 340 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.09 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.66 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.65 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.92 
 
 		 346 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.21 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.95 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.95 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  53.75 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.75 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.52 
 
 		 347 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.75 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.75 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.75 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.78 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  53.75 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.75 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.75 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.77 
 
 		 330 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  55 
 
 		 363 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1324  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.24 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.211473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.83 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.88 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3181  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.59 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 		 321 aa  371  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.3 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.15 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.64 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.07 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.02 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.27 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3205  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.84 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.88 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.56 
 
 		 346 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>