More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3181 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3181  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
338 aa  659    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.18 
 
 
342 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.67 
 
 
336 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  59.5 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.5 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  59.5 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.5 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.89 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.96 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.5 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.96 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.77 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.96 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.96 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.31 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.04 
 
 
363 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.96 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.96 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.85 
 
 
351 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.26 
 
 
345 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.96 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.5 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.96 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.62 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.5 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.5 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
354 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.16 
 
 
357 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 
344 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.42 
 
 
355 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.55 
 
 
357 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 
355 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.45 
 
 
351 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.42 
 
 
354 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.55 
 
 
357 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.59 
 
 
336 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.55 
 
 
352 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.66 
 
 
338 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.59 
 
 
336 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.32 
 
 
334 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 
354 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 
334 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 
334 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.59 
 
 
336 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.59 
 
 
336 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.59 
 
 
336 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.64 
 
 
348 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.31 
 
 
338 aa  391  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 
334 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 
338 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 
344 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.47 
 
 
354 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.66 
 
 
336 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.35 
 
 
336 aa  388  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.56 
 
 
358 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.78 
 
 
348 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.16 
 
 
356 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.67 
 
 
347 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.16 
 
 
355 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.49 
 
 
335 aa  391  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
334 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.47 
 
 
355 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 
334 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.11 
 
 
356 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
334 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 
334 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
334 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 
336 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 
334 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.81 
 
 
338 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.64 
 
 
358 aa  384  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.11 
 
 
356 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
334 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.75 
 
 
351 aa  386  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 
336 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
334 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.11 
 
 
356 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.18 
 
 
339 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 
334 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0561  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.14 
 
 
348 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.389647  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0172  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.27 
 
 
339 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.719394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 
348 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.09 
 
 
356 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.39 
 
 
356 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 
334 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.43 
 
 
334 aa  381  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  57.41 
 
 
341 aa  381  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 
334 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.11 
 
 
353 aa  381  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 
338 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1324  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.37 
 
 
355 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.211473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.43 
 
 
337 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.56 
 
 
330 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.79 
 
 
347 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
347 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 
334 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.57 
 
 
343 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>