More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5144 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 353 aa  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  86.78 
 
 		 348 aa  578  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2111  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.09 
 
 		 353 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00345242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.49 
 
 		 367 aa  484  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.56 
 
 		 370 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1810  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.43 
 
 		 354 aa  478  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.29 
 
 		 349 aa  474  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6111  Holliday junction DNA helicase B  73.65 
 
 		 352 aa  474  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0830946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1800  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.51 
 
 		 354 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383421  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.78 
 
 		 366 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.49 
 
 		 368 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2306  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.46 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2267  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.46 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2314  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.46 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2575  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.56 
 
 		 355 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1936  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.24 
 
 		 364 aa  470  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3824  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.7 
 
 		 357 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.265234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.35 
 
 		 351 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12612  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.92 
 
 		 344 aa  461  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3826  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.09 
 
 		 359 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0702287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.64 
 
 		 337 aa  461  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.39 
 
 		 355 aa  458  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.41 
 
 		 360 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.14 
 
 		 382 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2302  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.87 
 
 		 363 aa  460  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  71.95 
 
 		 374 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.25 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2031  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.88 
 
 		 361 aa  441  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000121008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17530  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  69.76 
 
 		 355 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.200391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1668  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.44 
 
 		 367 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1796  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.7 
 
 		 359 aa  437  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.116666 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2301  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.07 
 
 		 362 aa  435  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171399  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12880  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.98 
 
 		 340 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.579747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15320  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  64.16 
 
 		 357 aa  420  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.280238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1994  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.71 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13960  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  69.02 
 
 		 353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577435  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 357 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.56 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 357 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.91 
 
 		 357 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.09 
 
 		 363 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.25 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.89 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.78 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 		 358 aa  391  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 352 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.39 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 354 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.4 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.45 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.61 
 
 		 341 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.57 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.83 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 338 aa  381  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.55 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.91 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3181  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.11 
 
 		 338 aa  381  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1324  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.81 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.211473  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.88 
 
 		 355 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.62 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.7 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.33 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.51 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.51 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.71 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.72 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.74 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0453  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00906919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 358 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1215  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.75 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.423128  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.77 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.13 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>