More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0453 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0453  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 348 aa  698    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00906919  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  86.06 
 
 		 353 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.2 
 
 		 352 aa  412  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.47 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.35 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.86 
 
 		 355 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17530  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  62.43 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.200391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1668  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.49 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15320  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  61.83 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.280238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  60.06 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12880  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.78 
 
 		 340 aa  391  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.579747  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6111  Holliday junction DNA helicase B  60.68 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0830946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2306  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.36 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2267  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.36 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2314  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.36 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2031  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.56 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000121008 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 		 351 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.25 
 
 		 382 aa  381  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3824  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.61 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.265234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2301  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.29 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171399  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2575  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12612  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.11 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13960  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  63.64 
 
 		 353 aa  375  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2111  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00345242  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 		 353 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1936  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.83 
 
 		 364 aa  374  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2302  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.82 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.91 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1796  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.01 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.116666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.12 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3826  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.95 
 
 		 359 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0702287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.31 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1994  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.08 
 
 		 345 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.99 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1810  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.02 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1800  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.34 
 
 		 354 aa  360  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383421  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.42 
 
 		 336 aa  352  7e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.34 
 
 		 346 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.12 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.34 
 
 		 346 aa  349  3e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.6 
 
 		 334 aa  349  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.82 
 
 		 334 aa  349  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.82 
 
 		 334 aa  348  6e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.82 
 
 		 334 aa  348  8e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.82 
 
 		 334 aa  348  9e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.61 
 
 		 342 aa  347  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.11 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.73 
 
 		 334 aa  344  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.09 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.37 
 
 		 338 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.75 
 
 		 338 aa  343  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.6 
 
 		 334 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.78 
 
 		 334 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.68 
 
 		 343 aa  344  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.6 
 
 		 334 aa  343  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.6 
 
 		 336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.46 
 
 		 344 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 		 338 aa  342  5e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.78 
 
 		 338 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.92 
 
 		 337 aa  342  8e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.29 
 
 		 334 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.25 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.29 
 
 		 334 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.76 
 
 		 334 aa  340  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0578  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.93 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.4 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.61 
 
 		 334 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.42 
 
 		 334 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.42 
 
 		 334 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.61 
 
 		 334 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0049  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.95 
 
 		 332 aa  339  4e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.603347  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.19 
 
 		 337 aa  339  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0569  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.08 
 
 		 346 aa  339  5e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.78 
 
 		 349 aa  338  8e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 		 337 aa  338  8e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 		 338 aa  338  9e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.16 
 
 		 335 aa  338  9.999999999999999e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.29 
 
 		 334 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  53.09 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.55 
 
 		 334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.98 
 
 		 338 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.83 
 
 		 345 aa  335  5e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.41 
 
 		 338 aa  335  5e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 		 338 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.61 
 
 		 344 aa  335  7e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.91 
 
 		 337 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.76 
 
 		 335 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.77 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.42 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.62 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  52.38 
 
 		 355 aa  334  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.34 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  51.37 
 
 		 346 aa  333  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.99 
 
 		 336 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.83 
 
 		 346 aa  333  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.38 
 
 		 336 aa  332  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.47 
 
 		 333 aa  332  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.11 
 
 		 337 aa  333  4e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>