More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2093 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 351 aa  682    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  84.8 
 
 		 382 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2111  Holliday junction DNA helicase RuvB  80.06 
 
 		 353 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00345242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6111  Holliday junction DNA helicase B  76.59 
 
 		 352 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0830946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.68 
 
 		 349 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.33 
 
 		 367 aa  500  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.3 
 
 		 360 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2306  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.1 
 
 		 357 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2267  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.1 
 
 		 357 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2314  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.1 
 
 		 357 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.59 
 
 		 355 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3824  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.72 
 
 		 357 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.265234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.47 
 
 		 370 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17530  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  74.32 
 
 		 355 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.200391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2575  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.43 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.11 
 
 		 352 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  70.81 
 
 		 374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2302  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.11 
 
 		 363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12612  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.01 
 
 		 344 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.62 
 
 		 337 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.35 
 
 		 353 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1936  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.17 
 
 		 364 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.21 
 
 		 368 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1800  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.44 
 
 		 354 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383421  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3826  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.97 
 
 		 359 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0702287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1810  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.54 
 
 		 354 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1668  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.49 
 
 		 367 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1796  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.54 
 
 		 359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.116666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.17 
 
 		 366 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1994  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.04 
 
 		 345 aa  448  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.37 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2301  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.71 
 
 		 362 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171399  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2031  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.97 
 
 		 361 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000121008 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13960  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  71.87 
 
 		 353 aa  434  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577435  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12880  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.59 
 
 		 340 aa  434  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.579747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15320  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  67.06 
 
 		 357 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.280238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.76 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0453  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 		 348 aa  383  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00906919  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.92 
 
 		 351 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.51 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.4 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.32 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.42 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.36 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  55 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  54.19 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.19 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.89 
 
 		 541 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.19 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.84 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.89 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.19 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.19 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.57 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  54.19 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.42 
 
 		 334 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.03 
 
 		 354 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.06 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.32 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.42 
 
 		 334 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  56.35 
 
 		 346 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.82 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.19 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.42 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.85 
 
 		 334 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.19 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.19 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.36 
 
 		 340 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 		 333 aa  371  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.19 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  53.66 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.38 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.89 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.73 
 
 		 354 aa  371  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.25 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.89 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.07 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.19 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.14 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.19 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.32 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>