More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0569 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0569  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 346 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0616  Holliday junction DNA helicase RuvB  85.04 
 
 		 348 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  83.72 
 
 		 344 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1619  Holliday junction DNA helicase RuvB  81.23 
 
 		 344 aa  559  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.933878 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1767  Holliday junction DNA helicase RuvB  80.06 
 
 		 352 aa  554  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406751  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.12 
 
 		 343 aa  511  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0587  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.24 
 
 		 338 aa  478  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736056 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 		 342 aa  409  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.84 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1642  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.28 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000112926  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.92 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.23 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.39 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.780962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1251  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.27 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000492423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01270  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.02 
 
 		 340 aa  392  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0488  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.49 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.99 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.49 
 
 		 338 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.72 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.42 
 
 		 321 aa  371  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.52 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.9 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0629  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.61 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.151039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.52 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.19 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.39 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.22 
 
 		 356 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.28 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.17 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.32 
 
 		 346 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1095  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.96 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.508014  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.88 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.84 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.68 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  57.28 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.55 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3493  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.41 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 350 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.84 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.55 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1025  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.96 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.669152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0989  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.77 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.48 
 
 		 345 aa  364  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.09 
 
 		 354 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3205  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.02 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.25 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.22 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.53 
 
 		 345 aa  363  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.19 
 
 		 355 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 		 339 aa  362  4e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.98 
 
 		 354 aa  362  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.27 
 
 		 354 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 330 aa  362  6e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.75 
 
 		 343 aa  362  6e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.31 
 
 		 334 aa  361  8e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.3 
 
 		 343 aa  362  8e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 338 aa  361  9e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  53 
 
 		 338 aa  360  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 		 354 aa  360  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.96 
 
 		 346 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1357  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 		 351 aa  361  1e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 		 352 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.77 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.81 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.54 
 
 		 335 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.21 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.18 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.17 
 
 		 334 aa  360  3e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.52 
 
 		 334 aa  359  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0561  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 		 348 aa  359  4e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.389647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.88 
 
 		 334 aa  359  4e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>