More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1095 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1025  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 334 aa  667    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.669152  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1095  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 334 aa  667    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.508014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0152  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.09 
 
 		 347 aa  465  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00761409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1538  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.51 
 
 		 313 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0672252  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1357  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.33 
 
 		 351 aa  441  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.42 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4544  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.24 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.076063  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.7 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.13 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.62 
 
 		 338 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.61 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.88 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.13 
 
 		 346 aa  374  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  57.05 
 
 		 341 aa  374  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.13 
 
 		 330 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  55.77 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.77 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.88 
 
 		 333 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.92 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.96 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.88 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 363 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 361 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.47 
 
 		 338 aa  371  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.6 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.87 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.77 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.77 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.88 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.88 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 		 333 aa  371  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.64 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.77 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.6 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.77 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.83 
 
 		 346 aa  371  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  55.77 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.18 
 
 		 541 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.88 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.73 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.46 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.62 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.08 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.41 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.69 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.08 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.21 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.56 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.08 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.87 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.08 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.08 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.91 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.08 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.55 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.56 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.77 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.64 
 
 		 336 aa  368  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.69 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.41 
 
 		 338 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.21 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  55 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.21 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.23 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.08 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.69 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.96 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.08 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.66 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.53 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.66 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.78 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.95 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.63 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.09 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0569  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.96 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>